ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ GenOO-HTS ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ genoo-code-2013_04_18.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ GenOO-HTS ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
GenOO-HTS ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
GenOO-HTS [jee-noo] ເປັນແຫຼ່ງເປີດ; ໂຄງຮ່າງການ Perl ຮັດກຸມວັດຖຸຖືກພັດທະນາໂດຍສະເພາະສໍາລັບການອອກແບບຂອງເຄື່ອງມືການວິເຄາະລໍາດັບສູງ (HTS). ຈຸດປະສົງຕົ້ນຕໍຂອງ GenOO-HTS ແມ່ນເພື່ອເຮັດໃຫ້ການວິເຄາະ HTS ງ່າຍດາຍແລະສັບສົນເປັນໄປໄດ້. GenOO-HTS ສ້າງຕົວແບບຊີວະພາບເຂົ້າໄປໃນວັດຖຸ Perl ແລະສະຫນອງຄຸນລັກສະນະທີ່ກ່ຽວຂ້ອງແລະວິທີການທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ສໍາລັບການຫມູນໃຊ້ຂອງຂໍ້ມູນລໍາດັບຜ່ານສູງ. ການນໍາໃຊ້ GenOO-HTS ເປັນໂມດູນການພັດທະນາຫຼັກຊ່ວຍຫຼຸດຜ່ອນການ overhead ແລະຄວາມຊັບຊ້ອນຂອງການຄຸ້ມຄອງຂໍ້ມູນແລະຫນ່ວຍງານທາງຊີວະພາບຢູ່ໃນມື. GenOO-HTS ໄດ້ຖືກອອກແບບໃຫ້ມີຄວາມຍືດຫຍຸ່ນ, ສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ງ່າຍດ້ວຍໂຄງສ້າງແບບໂມດູລາແລະຄວາມຕ້ອງການຫນ້ອຍທີ່ສຸດສໍາລັບເຄື່ອງມືພາຍນອກແລະຫ້ອງສະຫມຸດ.ຄຸນລັກສະນະ
- ຈັດລະບຽບຊີວະວິທະຍາເປັນວັດຖຸ perl (ພາກພື້ນ genomic, gene, transcripts, introns/exons, ແລະອື່ນໆ)
- ຈັດລຽງລຳດັບຫົວໜ່ວຍເປັນວັດຖຸ/ຄຸນສົມບັດ (ການອ່ານຕາມລຳດັບ, ການຈັດຮຽງ, ແລະອື່ນໆ)
- ເຮັດໃຫ້ I/O ຈາກຮູບແບບໄຟລ໌ທີ່ໃຊ້ກັນຢ່າງກວ້າງຂວາງໄດ້ງ່າຍ (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- ມີຄວາມສອດຄ່ອງ ແລະສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ງ່າຍຂຶ້ນ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ນັກພັດທະນາ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/genoo/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
