ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ GMcloser ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ GMcloser-1.6.2.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ GMcloser ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
GMcloser
Ad
ລາຍລະອຽດ
GMcloser ຕື່ມຂໍ້ມູນໃສ່ແລະປິດຊ່ອງຫວ່າງທີ່ມີຢູ່ໃນສະພາແຫ່ງ scaffold, ໂດຍສະເພາະທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍການປະກອບ de novo ຂອງ genomes ທັງຫມົດທີ່ມີລໍາດັບການຜະລິດຕໍ່ໄປ (NGS) ອ່ານ. ບໍ່ເຫມືອນກັບເຄື່ອງມືປິດຊ່ອງຫວ່າງອື່ນໆທີ່ໃຊ້ພຽງແຕ່ອ່ານ NGS, GMcloser ໃຊ້ຊຸດ contig preassembled ຫຼືຊຸດອ່ານຍາວເປັນລໍາດັບເພື່ອປິດຊ່ອງຫວ່າງແລະໃຊ້ການອ່ານຄູ່ (PE) ແລະວິທີການທີ່ອີງໃສ່ຄວາມເປັນໄປໄດ້ເພື່ອປັບປຸງຄວາມຖືກຕ້ອງແລະປະສິດທິພາບຂອງຊ່ອງຫວ່າງ. ປິດ. ປະສິດທິພາບຂອງການປິດຊ່ອງຫວ່າງສາມາດເພີ່ມຂຶ້ນໂດຍການປິ່ນປົວຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງກັບຊຸດ contig ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.ຊຸດທີ່ມາພ້ອມກັບ, GMvalue, ແມ່ນເຄື່ອງມືເພື່ອກໍານົດສະຖານທີ່ທີ່ຜິດພາດໃນ contigs ແລະ scaffolds. ບໍ່ເຫມືອນກັບເຄື່ອງມືທີ່ກ່ຽວຂ້ອງອື່ນໆ, GMvalue ສາມາດກໍານົດປະເພດ misassembly ໂດຍມີຫຼາຍທາງເລືອກ, ແລະສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ກັບການປະກອບຂອງ genome ຂະຫນາດໃຫຍ່. ໂດຍການນໍາໃຊ້ທາງເລືອກ -e, GMvalue ຍັງສ້າງການປະກອບທີ່ບໍ່ມີຄວາມຜິດພາດໂດຍການແຍກຫຼືແກ້ໄຂ misassembles.
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/gmcloser/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
