delta2maf - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

delta2blocks - മഗ്സിയുടെ പാച്ച് മുതൽ അലൈൻമെന്റുകൾ അടുക്കുന്നതിനുള്ള മമ്മറിനുള്ള അധിക ഉപകരണം
delta2maf - പാച്ച് ഓഫ് മഗ്‌സി മുതൽ അലൈൻമെന്റുകൾ അടുക്കുന്നതിനുള്ള മമ്മറിനുള്ള അധിക ഉപകരണം

സിനോപ്സിസ്

ഡെൽറ്റ2ബ്ലോക്കുകൾ [ഓപ്ഷനുകൾ]<refഐഡി><qryഐഡി>
ഡെൽറ്റ2മാഫ് [ഓപ്ഷനുകൾ]<refഐഡി><qryഐഡി>

വിവരണം

-h സഹായ വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുക

-q അന്വേഷണ ആരംഭ കോർഡിനേറ്റ് പ്രകാരം വിന്യാസങ്ങൾ അടുക്കുക

-r റഫറൻസ് ആരംഭ കോർഡിനേറ്റ് പ്രകാരം വിന്യാസങ്ങൾ അടുക്കുക

-w int സ്ക്രീൻ വീതി സജ്ജമാക്കുക - സ്ഥിരസ്ഥിതി 60 ആണ്

-x int മാട്രിക്സ് തരം സജ്ജമാക്കുക - ഡിഫോൾട്ട് 2 ആണ് (BLOSUM 62), മറ്റ് ഓപ്ഷനുകളിൽ 1 ഉൾപ്പെടുന്നു (BLOSUM 45)
കൂടാതെ 3 (ബ്ലോസം 80)
ശ്രദ്ധിക്കുക: അമിനോ ആസിഡ് വിന്യാസത്തിൽ മാത്രമേ സ്വാധീനം ചെലുത്തൂ

ഇൻപുട്ട് എന്നത് "nucmer" അല്ലെങ്കിൽ "promer" പ്രോഗ്രാമിന്റെ .delta ഔട്ട്പുട്ടാണ്
കമാൻഡ് ലൈൻ.

ഔട്ട്‌പുട്ട് stdout ആണ്, കൂടാതെ അന്വേഷണത്തിനും റഫറൻസിനും ഇടയിലുള്ള എല്ലാ വിന്യാസങ്ങളും അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു
കമാൻഡ് ലൈനിൽ സീക്വൻസുകൾ തിരിച്ചറിഞ്ഞു.

ശ്രദ്ധിക്കുക: ഡിഫോൾട്ടായി സോർട്ടിംഗൊന്നും ചെയ്യപ്പെടുന്നില്ല, അതിനാൽ അലൈൻമെന്റുകൾ അതിൽ കാണുന്നതുപോലെ ഓർഡർ ചെയ്യപ്പെടും
ദി ഇൻപുട്ട്.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് delta2maf ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക