ഡൈജസ്റ്റ് - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

ഡൈജസ്റ്റ് - പ്രോട്ടീൻ പ്രോട്ടിയോലൈറ്റിക് എൻസൈം അല്ലെങ്കിൽ റിയാജന്റ് ക്ലീവേജ് സൈറ്റുകളെക്കുറിച്ചുള്ള റിപ്പോർട്ടുകൾ

സിനോപ്സിസ്

ഡൈജസ്റ്റ് -seqall തുടർച്ചയായി -mwdata ഡാറ്റ ഫയൽ -മെനു പട്ടിക -മോണോ ബൂളിയൻ - അനുകൂലമല്ലാത്ത ബൂളിയൻ
-റാഗിംഗ് ബൂളിയൻ - ടെർമിനി പട്ടിക -ഓവർലാപ്പ് ബൂളിയൻ -എല്ലാ കക്ഷികളും ബൂളിയൻ
- outfile റിപ്പോർട്ട്

ഡൈജസ്റ്റ് -ഹെൽപ്പ്

വിവരണം

ഡൈജസ്റ്റ് EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ
സോഫ്റ്റ്‌വെയർ സ്യൂട്ട്"). ഇത് "പ്രോട്ടീൻ:മോട്ടിഫ്സ്" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിന്റെ(കളുടെ) ഭാഗമാണ്.

ഓപ്ഷനുകൾ

ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
-seqall തുടർച്ചയായി

-mwdata ഡാറ്റ ഫയൽ
അമിനോ ആസിഡുകൾക്കായുള്ള തന്മാത്രാ ഭാരം ഡാറ്റ ഡിഫോൾട്ട് മൂല്യം: Emolwt.dat

ആവശ്യമായ വിഭാഗം
-മെനു പട്ടിക
സ്ഥിര മൂല്യം: 1

-മോണോ ബൂളിയൻ
സ്ഥിര മൂല്യം: എൻ

വിപുലമായ വിഭാഗം
- അനുകൂലമല്ലാത്ത ബൂളിയൻ
'KR'-ന് ശേഷം 'KRIFLP'-ൽ ഏതെങ്കിലും ഒന്ന് പിന്തുടരുകയാണെങ്കിൽ ട്രിപ്സിൻ സാധാരണയായി മുറിക്കില്ല.
Lys-C സാധാരണയായി 'K' ന് ശേഷം 'P' ആണെങ്കിൽ അത് മുറിക്കില്ല. Arg-C ചെയ്യില്ല
സാധാരണയായി 'R' ശേഷം 'P' ആണെങ്കിൽ മുറിക്കുക. V8-bicarb സാധാരണയായി വെട്ടിക്കുറയ്ക്കില്ല
'ഇ' അതിന് ശേഷം ഏതെങ്കിലും 'കെആർഇപി' ഉണ്ടെങ്കിൽ. V8-foss സാധാരണയായി 'DE' കഴിഞ്ഞാൽ മുറിക്കില്ല
അവയ്ക്ക് പിന്നാലെ 'P' വരുന്നു. ചൈമോട്രിപ്സിൻ സാധാരണയായി 'FYWLM' കഴിഞ്ഞാൽ മുറിക്കില്ല
പിന്നാലെ 'പി'. അനുകൂലമല്ലാത്തത് വ്യക്തമാക്കുന്നത് ഈ പ്രതികൂലമായ വെട്ടിക്കുറവുകളും അതുപോലെ തന്നെ
ഇഷ്ടപ്പെട്ടവ.

-റാഗിംഗ് ബൂളിയൻ
അർദ്ധ-നിർദ്ദിഷ്ടവും നോൺ-സ്പെസിഫിക് ദഹനവും അനുവദിക്കുന്നു. ഈ ഓപ്ഷൻ പ്രത്യേകിച്ചും ഉപയോഗപ്രദമാണ്
ഉപയോഗിച്ച് പ്രോട്ടീൻ തിരിച്ചറിയലിനായി പെപ്റ്റൈഡ് സീക്വൻസുകളുടെ ലിസ്റ്റുകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്നതിന്
മാസ്-സ്പെക്ട്രോമെട്രി.

- ടെർമിനി പട്ടിക
സ്ഥിര മൂല്യം: 1

ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
-ഓവർലാപ്പ് ബൂളിയൻ
ഭാഗിക ദഹനത്തിന് ഉപയോഗിക്കുന്നു. ഇഷ്ടപ്പെട്ട കട്ട് സൈറ്റുകളിൽ നിന്നുള്ള എല്ലാ കട്ടുകളും കാണിക്കുന്നു കൂടാതെ 1..3, 2..4,
3..5 മുതലായവ എന്നാൽ അല്ല (ഉദാ) 2..5. അതിനാൽ ഓവർലാപ്പുകൾ കൃത്യമായ ഒന്നുള്ള ശകലങ്ങളാണ്
അതിനുള്ളിൽ സാധ്യതയുള്ള കട്ട് സൈറ്റ്.

-എല്ലാ കക്ഷികളും ബൂളിയൻ
ഓവർലാപ്പിനെ സംബന്ധിച്ചിടത്തോളം, ഒന്നിലധികം സാധ്യതയുള്ള കട്ട് സൈറ്റുകൾ അടങ്ങിയ ശകലങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്.

- outfile റിപ്പോർട്ട്

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഡൈജസ്റ്റ് ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക