hmm2fetch - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

hmm2fetch - ഒരു HMM ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് ഒരു HMM വീണ്ടെടുക്കുക

സിനോപ്സിസ്

hmm2fetch [ഓപ്ഷനുകൾ] ഡാറ്റാബേസ് പേര്

വിവരണം

hmm2fetch എന്ന് വിളിക്കപ്പെടുന്ന ഒരു എച്ച്എംഎം വീണ്ടെടുക്കുന്ന ഒരു ചെറിയ യൂട്ടിലിറ്റി ആണ് പേര് ഒരു HMMER മോഡൽ ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന്
വിളിച്ചു ഡാറ്റാബേസ്. ഒരു പുതിയ ഫോർമാറ്റിൽ, ആ മോഡൽ സ്റ്റാൻഡേർഡ് ഔട്ട്പുട്ടിലേക്ക് പ്രിന്റ് ചെയ്യുന്നു. ഉദാഹരണത്തിന്,
hmm2fetch Pfam rrm Pfam-ൽ നിന്ന് RRM (RNA റെക്കഗ്നിഷൻ മോട്ടിഫ്) മോഡൽ വീണ്ടെടുക്കുന്നു
പരിസ്ഥിതി വേരിയബിൾ HMMERDB Pfam ഡാറ്റാബേസിന്റെ സ്ഥാനത്തേക്ക് സജ്ജീകരിച്ചിരിക്കുന്നു. വീണ്ടെടുത്തത്
HMM ഫയൽ HMMER 2 ASCII ഫോർമാറ്റിലാണ് എഴുതിയിരിക്കുന്നത്.

ഡാറ്റാബേസിൽ ഒരു അനുബന്ധ GSI സൂചിക ഫയൽ ഉണ്ടായിരിക്കണം. ഒരു HMM ഡാറ്റാബേസ് സൂചികയിലാക്കാൻ, ഉപയോഗിക്കുക
പ്രോഗ്രാം hmm2 സൂചിക.

ഓപ്ഷനുകൾ

-h പ്രിന്റ് ഹ്രസ്വ സഹായം; പതിപ്പ് നമ്പറും ഉൾപ്പെടെ എല്ലാ ഓപ്ഷനുകളുടെയും സംഗ്രഹവും ഉൾപ്പെടുന്നു
വിദഗ്ധ ഓപ്ഷനുകൾ.

-n വ്യാഖ്യാനിക്കുക പേര് പേരിന് പകരം ഒരു HMM നമ്പറായി. നമ്പറിംഗ് ആരംഭിക്കുന്നത് 0-ൽ നിന്നാണ്
ഉദാഹരണത്തിന്, ഒരു HMM ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് ആദ്യത്തെ HMM ലഭ്യമാക്കുന്നതിന് foo, നിങ്ങൾ ചെയ്യും
hmm2fetch -n 0 foo

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് hmm2fetch ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക