Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ MAC OS เดเตบเดฒเตเตป เดเดฎเตเดฒเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดจเตเดจเดฟเดเตเดเดจเตเดฏเตเดณเตเดณ เดเดเตเดเดณเตเดเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดธเตเดเดจเตเดฏ เดเตบเดฒเตเตป เดตเตผเดเตเดเตโเดธเตเดฑเตเดฑเตเดทเดจเตเดเดณเดฟเดฒเตเดจเตเดจเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต OnWorks เดธเตเดเดจเตเดฏ เดนเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดฆเดพเดคเดพเดตเดฟเตฝ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเตเดจเตเดจ เดเดฎเดพเตปเดกเต เดเดฟเดเดเต-เดชเตเดฐเตเดฌเดพเดฃเดฟเดคเต.
เดชเดเตเดเดฟเด:
NAME
เดเดฟเดเดเต-เดชเตเดฐเตเดฌเต - เดชเตเดฐเตเดเตเดเตเตป เดเดจเตเดฑเดฑเดพเดฑเตเดฑเตเดฎเดฟเดเต เดชเดพเดเตเดเดฟเดเดเต เดตเดฟเดฒเดฏเดฟเดฐเตเดคเตเดคเตเดเดฏเตเด เดฆเตเดถเตเดฏเดตเตฝเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดเดฏเตเด เดเตเดฏเตเดฏเตเด
เดตเดฟเดตเดฐเดฃเด
เดตเดพเดเตเดฏเดเดเดจ: เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเด input.pdb >> out.kin
เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ: เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเด [เดซเตเดฒเดพเดเตเดเตพ] "src เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ" ["เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ"] pdbfiles... >> out.kin
เดซเตเดฒเดพเดเตเดเตพโ:
-เดธเตเดตเดฏเด เดธเตเดตเดฏเด เดเดตเดฒ: src -> src (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
- เดฐเดฃเตเดเตเด เดฐเดฃเตเดเต เดตเดดเดฟเดเดณเตเด เดฎเตเดฑเดฟเดเตเดเตเด: src <=> targ
-เดเดฐเดฟเดเตเดเดฒเต เดเดฑเตเดฑ เดเดตเดฒ: src -> เดเดพเตผเดเต
-เดเดเตเดเต เดเดธเตเดเตผเดธเดฟเดฏเตเดเต เดฌเดพเดนเตเดฏ เดตเดพเตป เดกเตเตผ เดตเดพเตฝเดธเต เดเดชเดฐเดฟเดคเดฒเด (เดฒเดพเดฏเด เดเตเตบเดเดพเดเตเดฑเตเดฑเต เดเดชเดฐเดฟเดคเดฒเด)
-เดเดเตเดเตเดฌเตเดฃเตเดเตเดฐเตเดเตเดเต เดซเดฏเดฒเดฟเดจเตเดฑเต เดชเตเดฐเต
เดเดฐเต autobondrot เดซเดฏเตฝ เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเต เดชเตเดฐเตเดธเดธเตเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด
เดเตเดฑเตเดเตเดเตเดตเดดเดฟเดเตพ:
< > เด เดคเตเดชเตเดฒเต: -4 เดเดเตเดเต -เดเดเดธเดฟ -เดนเตเดฑเตเดฑเต - เดธเตเดตเดฏเด "altA ogt33"
-เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเตเดเตพ
เด เดคเตเดชเตเดฒเต: < >, เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดฎเดฑเตเดฑเต เดเดฟเดฒ เดซเตเดฒเดพเดเตเดเตพ เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
-เดเดธเตโเดธเดฟ เดเดชเดฐเดฟเดคเดฒเด เด เดคเตเดชเตเดฒเต: - เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต -เดฑเดพเดกเต1.4 -เดชเตเดฑเดคเตเดคเต "เดตเตเดณเตเดณเดฎเดฒเตเดฒ"
-เดเดเตเดธเตเดชเตเดธเตเดกเต
เด เดคเตเดชเตเดฒเต: - เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต -เดฑเดพเดกเต1.4 -เดชเตเดฑเดคเตเดคเต (เดถเตเดฐเดฆเตเดงเดฟเดเตเดเตเด: เดเดชเดฏเตเดเตเดคเต เดตเดฟเดคเดฐเดฃ เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ)
- เดเดชเดฐเดฟเดคเดฒเด
เด เดคเตเดชเตเดฒเต: - เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต -เดฑเดพเดกเต0.0 -1 เดเตเตผเดเตเดเตเด.4 -เดชเตเดฑเดคเตเดคเต "เดตเตเดณเตเดณเดฎเดฒเตเดฒ"
-เดชเตเดฐเดตเตเดถเดจเด
เด เดคเตเดชเตเดฒเต: - เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต -เดฑเดพเดกเต0.0 -1 เดเตเตผเดเตเดเตเด.4 -เดชเตเดฑเดคเตเดคเต (เดถเตเดฐเดฆเตเดงเดฟเดเตเดเตเด: เดเดชเดฏเตเดเตเดคเต เดตเดฟเดคเดฐเดฃ เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ)
-SCAN0 เด เดคเตเดชเตเดฒเต: -4 เดเดเตเดเต -เดเดเดธเดฟ - เดธเตเดตเดฏเด "alta blt40 ogt33"
-SCAN1 เด เดคเตเดชเตเดฒเต: -4 เดเดเตเดเต -เดเดฐเดฟเดเตเดเดฒเต "sc alta blt40 ogt33" "alta blt40 ogt65,(เดตเตเดณเตเดณเด ogt33 เด เดฒเตเดฒ)"
-เดกเดเดชเดฑเตเดฑเตเดฎเดฟเตปเดซเต
เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดชเตเดชเดฟเดฒเต เดเดฑเตเดฑเดเตเดเตพ เดเดฃเตเดฃเตเด: src
(เดฐเดฃเตเดเตเด เดเดฐเดฟเดเตเดเตฝ เดเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดฐเดฃเตเดเต เดชเดพเดฑเตเดฑเตเดฃเตเดเตพ เดเดตเดถเตเดฏเดฎเดพเดฃเตเดจเตเดจเต เดถเตเดฐเดฆเตเดงเดฟเดเตเดเตเด
เดเดเตเดเต, เดธเตเตฝเดซเต, เดกเดเดชเดฑเตเดฑเตเดฎเดฟเตปเดซเต เดเดจเตเดจเดฟเดตเดฏเตเดเตเดเต เดเดฐเต เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ เดฎเดคเดฟ)
- เดชเดฐเตเดเตเดทเดฎเดพเดฏเดฟ
เด เดตเตเดฏเดเตเดคเดฎเดพเดฏ เดนเตเดกเตเดฐเดเตป
-เดตเตเดฏเดเตเดคเด
เดตเตเดฏเดเตเดคเดฎเดพเดฏ เดนเตเดกเตเดฐเดเตป (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-เดธเดพเดจเตเดฆเตเดฐเดค#
เดกเตเดเตเดเต เดธเดพเดจเตเดฆเตเดฐเดค เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเด (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต 16 เดกเตเดเตเดเตเดธเต/เดธเตเดเตเดตเดฏเตผ เด)
-เดเดฐเด#.#
เดชเตเดฐเตเดฌเต เดเดฐเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.25 เด)
-ADDvdw#.#
เดตเดพเตป เดกเตเตผ เดตเดพเตฝเดธเต เดฑเตเดกเดฟเดฏเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดเดซเตเดธเตเดฑเตเดฑเต เดเตเตผเดคเตเดคเต (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.0)
-เด เดณเดตเต#.# เดตเดพเตป เดกเตเตผ เดตเดพเตฝเดธเต เดฑเตเดกเดฟเดฏเดฟเดจเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดธเตเดเตเดฏเดฟเตฝ เดเดเดเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 1.0)
-COSCale#.#
เดธเตเดเตเดฏเดฟเตฝ C=O เดเดพเตผเดฌเตบ เดตเดพเตป เดกเตเตผ เดตเดพเตฝเดธเต เดเดฐเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.94)
- เดธเตเดชเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพเดเตเดเต เดชเดเดฐเด เดธเตเดชเตเดเตเดเต เดตเดฐเดฏเตเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
- เดธเตเดชเตเดเตเดเต#.#
เดธเตเดชเตเดเตเดเต เดธเตเดเตเดฏเดฟเตฝ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ=0.5)
- เดจเตเดธเตเดชเตเดเตเดเต
เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดฎเดพเดคเตเดฐเด เดตเดฐเดฏเตเดเตเดเตเด
-HB เดฑเตเดเตเดฒเตผ#.# เดฑเตเดเตเดฒเตผ เดเดเตเดเตเดฌเตเดฃเตเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เดเดตเตผเดฒเดพเดชเตเดชเต (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต=0.6)
-HBCเดเดพเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดคเตเดเดพเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดค Hbonds-เดจเต #.# เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เดเดตเตผเดฒเดพเดชเตเดชเต (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต=0.8)
- เดธเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดเตเดเดพเดคเตเดค เดเดฑเตเดฑเดเตเดเตพ เดธเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดเตเดเดพเดคเตเดค เดเดฑเตเดฑเดเตเดเตพ เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด
-เดชเดฐเดฟเดงเดฟ เดเตเดเดฌเดฟเดเตเดเตเดฎเตเดชเตเตพ เดฌเดฎเตเดชเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เดฆเตเดฐเดคเตเดคเตเดเตเดเต เดชเดฐเดฟเดฎเดฟเดคเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดฏเดฟเดฒเตเดฒ
เดฌเดฎเตเดชเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดชเดฐเดฟเดฎเดฟเดคเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฐเตเดคเต
-เดฒเตเดจเตเดธเต เดเดฟเตป เดซเดฏเดฒเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดฒเตเตปเดธเต เดเตเดตเตเดกเต เดเตเตผเดเตเดเตเด
-เดจเตเดฒเตเตปเดธเต
เดเดฟเตป เดซเดฏเดฒเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดฒเตเตปเดธเต เดเตเดตเตเดกเต เดเตเตผเดเตเดเดฐเตเดคเต (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-เดเด.เดธเดฟ เดฎเตเดฏเดฟเตปเดเตเดฏเดฟเตป->เดฎเตเดฏเดฟเตปเดเตเดฏเดฟเตป เดเดเดชเตเดเดฒเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต
-เดเดเตเดเตเดเดเดฟเดเตพ เดจเตเตบ-เดตเดพเดเตเดเตผ HET เดเตเดฐเตเดชเตเดชเตเดเดณเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-เดจเตเดนเตเดฑเตเดฑเตเดเตพ
เดจเตเตบ-เดตเดพเดเตเดเตผ HET เดเตเดฐเตเดชเตเดชเตเดเดณเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดเดดเดฟเดตเดพเดเตเดเตเด
-เดตเตเดณเตเดณเด
เดตเตเดณเตเดณเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-NOWATers
เดตเตเดณเตเดณเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดเดดเดฟเดตเดพเดเตเดเตเด
-WAT2wat
เดตเตเดณเตเดณเดเตเดเตพเดเตเดเดฟเดเดฏเดฟเตฝ เดกเตเดเตเดเตเดเตพ เดเดพเดฃเดฟเดเตเดเตเด
-เดกเดเดชเต2เด
เดตเตเดณเตเดณเด H เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฃเต? เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ เดตเตเดเตเดฑเตเดฑเตผเดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเต
-4 เดเดเตเดเต H-เดจเต เดตเตเดฃเตเดเดฟ เดฌเตเดฃเตเดเต เดเตเดฏเดฟเตป เดกเตเดเตเดเต เดจเตเดเตเดเด 4 เดเดฏเดฟ เดจเตเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-3 เดฌเตเดฃเตเดเต เดเตเดฏเดฟเตป เดกเตเดเตเดเต เดจเตเดเตเดเด 3 เดเดฏเดฟ เดชเดฐเดฟเดฎเดฟเดคเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด
-2 เดฌเตเดฃเตเดเต เดเตเดฏเดฟเตป เดกเตเดเตเดเต เดจเตเดเตเดเด 2 เดเดฏเดฟ เดชเดฐเดฟเดฎเดฟเดคเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด
-1 เดฌเตเดฃเตเดเต เดเตเดฏเดฟเตป เดกเตเดเตเดเต เดจเตเดเตเดเด 1 เดเดฏเดฟ เดชเดฐเดฟเดฎเดฟเดคเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด
-เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเตเด "เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ" เดตเตเดฏเดเตเดคเดฎเดพเดฏ เดกเตเดฐเตเดชเตเดชเต: เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ เด เดจเตเดธเดฐเดฟเดเตเดเต เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดค เดเดฑเตเดฑเดเตเดเดณเต เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเตเด
-DOCHO
CH..O Hbonds เดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฑเดฟเดฏเตเด
-เดเต#.#
CH..O Hbond เดธเตเดเตเดฑเดฟเดจเตเดณเตเดณ เดธเตเดเตเดฏเดฟเตฝ เดเดเดเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ=0.5)
-เดชเตเดณเดพเตผ เดเดเตเดเต
เดงเตเดฐเตเดตเตเดฏ เดนเตเดกเตเดฐเดเดจเตเดฑเต เดนเตเดฐเดธเตเดต เดเดฐเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
-NOPolarH
เดงเตเดฐเตเดตเตเดฏ เดนเตเดกเตเดฐเดเดจเตเดฑเต เดเดฐเดเตเดเตพ เดเตเดฑเตเดคเดพเดเตเดเดฐเตเดคเต
-NOFACEhbond เดเดเตเดเตเดฌเตเดฃเตเดเตเดเดณเต เดธเตเดเดจเตเดงเดฎเตเดณเตเดณ เดฎเตเดเดเตเดเดณเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฑเดฟเดฏเดฐเตเดคเต
-เดจเดพเดฎเด "เดชเตเดฐเต" เดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟเดจเตเดฑเต เดชเตเดฐเต เดตเตเดฏเดเตเดคเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต (เดธเตเดฅเดฟเดฐ "เดกเตเดเตเดเต")
-เดกเตเดเตเดเตเดฎเดพเดธเตเดฑเตเดฑเตผ
เดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเตเดเดณเดฟเตฝ เด เดงเดฟเด เดฎเดพเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดพเดฏเดฟ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟเดจเตเดฑเต เดชเตเดฐเต={name}
-NOGroup
.kin เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ @group เดชเตเดฐเดธเตเดคเดพเดตเดจ เดธเตเดทเตเดเดฟเดเตเดเดฐเตเดคเต
-เดเตเตปเดฎเตเดเต
.kin เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเดฟเดจเตเดฑเต เดฎเตเดเดณเดฟเตฝ @kinemage 1 เดชเตเดฐเดธเตเดคเดพเดตเดจ เดเตเตผเดเตเดเตเด
-เดเตเดฃเตเดเตเดกเตเดเตเดเตเดเตพ
เดกเตเดเตเดเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดเดฃเตเดเดพเดเตเดเตเด-เดเดฐเต เดกเตเดเตเดเตโเดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเต เด เดฒเตเดฒ
- เดตเดฟเดตเดฐเดฎเดฟเดฒเตเดฒเดพเดคเตเดคเดคเต
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดฑเต เดกเตเดเตเดเต เดตเดฟเดตเดฐเด
name:pat:type:srcAtom:targAtom:mingap:gap:spX:
spY:spZ:spikeLen:score:stype:ttype:x:y:z:sBval:tBval:
-เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต
เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเต เดตเดฟเดตเดฐเด O-เดฏเดฟเตฝ เดชเตเดฐเดฆเตผเดถเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดเตเดฏเตโเดคเต
-XVFORMAT
XtalView-เตฝ เดชเตเดฐเดฆเตผเดถเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดกเตเดเตเดเต เดตเดฟเดตเดฐเด เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดเตเดฏเตโเดคเต
-เดตเตบเดฒเตเตป
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเดฐเต เดตเดฐเดฟ :contacts:by:severity:type:
-GAPcolor
เดตเดฟเดเดตเต เดคเตเด เดชเตเดฐเดเดพเดฐเด เดตเตผเดฃเตเดฃ เดกเตเดเตเดเตเดเตพ (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต)
-ATOMcolor
เดเดฑเตเดฑเด เดคเดฐเด เด เดจเตเดธเดฐเดฟเดเตเดเต เดตเตผเดฃเตเดฃ เดกเตเดเตเดเตเดเตพ
-เดฌเตเดธเต เดเดณเตผ
เดจเตเดฏเตเดเตเดฒเดฟเดเต เดเดธเดฟเดกเต เดฌเตเดธเต เดคเดฐเด เด เดจเตเดธเดฐเดฟเดเตเดเต เดเดณเตผ เดกเตเดเตเดเตเดเตพ
-COLORเดฌเตเดธเต
เดตเดฟเดเดตเตเด เดจเตเดฏเตเดเตเดฒเดฟเดเต เดเดธเดฟเดกเต เดฌเตเดธเต เดคเดฐเดตเตเด เด เดจเตเดธเดฐเดฟเดเตเดเต เดเดณเตผ เดกเตเดเตเดเตเดเตพ
-เดเดเตเดเตโเดเตเดฒเตเตผ "เดชเตเดฐเต" เดเดจเตเดจเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดชเตเดฏเดฟเดจเตเดฑเต เดจเดฟเดฑเด เดตเตเดฏเดเตเดคเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต -เดเดเตเดเต (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต "เดเตเดฐเต")
-GAP เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเต#
เดธเตเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดตเดฟเดเดตเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดญเดพเดฐเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.25)
-เดฌเดฎเตเดชเต เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเตเดฌเดฎเตเดชเตเดเตพ เดธเตโเดเตเตผ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ # เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดธเตเดเตเดฏเดฟเตฝ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต 10.0)
-HBเดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเต#
Hbonds เดธเตเดเตเตผ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดธเตเดเตเดฏเดฟเตฝ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 4.0)
-เดกเดฟเดตเต เดฒเต#.#
เดฌเดฎเตเดชเต เดตเดฟเดญเดพเดเดเตเดเตพเดเตเดเตเดณเตเดณ เดกเดฟเดตเดฟเดทเตป (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต -0.เดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ)
-เดกเดฟเดตเตเดนเต#.#
เดเตเตบเดเดพเดเตเดฑเตเดฑเต เดตเดฟเดญเดพเดเดเตเดเตพเดเตเดเตเดณเตเดณ เดกเดฟเดตเดฟเดทเตป (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต 0.25)
-เดฎเดฟเดจเตเดเตเดเตเดชเตปเดธเดฟ#.#
เดเดคเดฟเดจเต เดคเดพเดดเตเดฏเตเดณเตเดณ เดคเดพเดฎเดธเด เดชเตเดเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเต เดคเตเดฒเตเดฏเดฎเดพเดฃเต (เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต 0.02)
-เดเดเดเด
เดเดฟเตป เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ เดตเตเดฏเดคเตเดฏเดธเตเดค เดเดเดเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดฎเดพเดธเตเดฑเตเดฑเตผ เดฌเดเตเดเดฃเตเดเตพ เดเตเตผเดเตเดเตเด
-เดจเตเดนเตเดฌเตเดเตเดเต
HBonds-เดจเดพเดฏเดฟ เดเตเตบเดเดพเดเตเดฑเตเดฑเตเดเตพ เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดฐเตเดคเต
-เดจเตเดเตเดฒเดพเดทเตเดเตเดเต
เดเดฑเตเดฑเตเดฎเตเดเตเดเดฒเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดเตเตบเดเดพเดเตเดฑเตเดฑเตเดเตพ เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดฐเตเดคเต
-เดจเตเดตเตเดกเตเดเตเดเต
เดตเดพเตป เดกเตเตผ เดตเดพเตฝเดธเต เดเดเดชเตเดเดฒเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดเตเตบเดเดพเดเตเดฑเตเดฑเตเดเตพ เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดฐเตเดคเต
-เดฌเดพเดกเตเดเตเดเต เดฎเดพเดคเตเดฐเด
เดฌเดพเดกเตเดเดเตเดเต เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดฎเตเดถเด เดเตเดฒเดพเดทเตเดเตพ (เดเดเตเดคเตเดค เดเดตเตผเดฒเดพเดชเตเดชเต เดเตเตบเดเดพเดเตเดฑเตเดฑเตเดเตพ)
-เดธเดเดเตเดฐเดนเด
เดเตเตบเดเดพเดเตโเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเตเดฏเตเด เดเตเดฒเดพเดทเตเดเดณเตเดเตเดฏเตเด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดธเดเดเตเดฐเดน เดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเต
-เดตเตบเดฒเตเตป
เดเตบเดฒเตเดจเดฟเตฝ เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดธเดเดเตเดฐเดน เดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเต
- เดจเตเดเตเดเดฟเดเตเดเตเดเตพ
เดชเตเดฐเตเดธเดธเตเดธเดฟเดเดเต เดธเดฎเดฏเดคเตเดคเต เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดจเดพเดฎ เดเดฟเดเตเดเตผ เดชเตเดฐเดฆเตผเดถเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดฐเตเดคเต
-STDBOND-เดเตพ
เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃ เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเดเตเดเดณเดฟเตฝ เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃ เดฌเตเดฃเตเดเดฟเดเดเต เดชเดพเดฑเตเดฑเตเดฃเตเดเตพ เดฎเดพเดคเตเดฐเด เด เดจเตเดฎเดพเดจเดฟเดเตเดเตเด
-เดจเตเดชเดพเดฐเดจเตเดฑเต
เดชเดพเดฐเดจเตเดฑเต เดนเตเดตเดฟ เดเดฑเตเดฑเดเตเดเดณเตเดเต เดชเดเตเดเดฟเดเดฏเต เด เดเดฟเดธเตเดฅเดพเดจเดฎเดพเดเตเดเดฟ เดนเตเดกเตเดฐเดเตป เดฌเดจเตเดงเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดฐเตเดคเต
-SEGID เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเดเตเดเตพ เดคเดฎเตเดฎเดฟเตฝ เดตเดฟเดตเดฐเดฟเดเตเดเดพเตป PDB SegID เดซเตเตฝเดกเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
-OLDU เดชเดดเดฏ เดถเตเดฒเดฟ เดธเตเดทเตเดเดฟเดเตเดเตเด -u เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต: kissEdge2BullsEye, เดฎเตเดคเดฒเดพเดฏเดต
-VErbose
เดตเตเตผเดฌเตเดธเต เดฎเตเดกเต (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ)
- เดฑเดซเดฑเตปเดธเต
เดฑเดซเดฑเตปเดธเต เดธเตเดเตเดฐเดฟเดเดเต เดชเตเดฐเดฆเตผเดถเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเด
-เดฎเดพเดฑเตเดฑเดเตเดเตพ
เดชเตเดฐเตเดเตเดฐเดพเด เดฎเดพเดฑเตเดฑเดเตเดเดณเตเดเต เดเดฐเต เดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเต เดชเตเดฐเดฆเตผเดถเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเด
- เดจเดฟเดถเดฌเตเดฆเด เดจเดฟเดถเดฌเตเดฆ เดฎเตเดกเต
-เดธเดนเดพเดฏเด เดตเดฟเดชเตเดฒเตเดเดฐเดฟเดเตเด เดธเดนเดพเดฏ เด เดฑเดฟเดฏเดฟเดชเตเดชเต เดเดพเดฃเดฟเดเตเดเตเด (เดฎเดฑเตเดฑเต เดซเตเดฒเดพเดเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต)
-เดชเดคเดฟเดชเตเดชเต
stdout-เดฒเตเดเตเดเตเดณเตเดณ เดเดฐเต เดตเดฐเดฟ เดชเดคเดฟเดชเตเดชเต
เดชเดพเดฑเตเดฑเตเตบ เดเดเดเดเตเดเตพ: (เดเดฎเดพเตปเดกเต เดฒเตเดจเดฟเตฝ เดเดฆเตเดงเดฐเดฃเดฟเดเตพ เดจเตฝเดเดฃเด)
FILE# เดซเดฏเดฒเดฟเดจเตเดณเตเดณเดฟเตฝ #
MODEL# เดฎเตเดกเดฒเดฟเดจเตเดณเตเดณเดฟเตฝ #
เดเตเดจเดพ
เดเตเดฏเดฟเตป เดเดณเตเดณเดฟเตฝ a
SEGaaaa
เดธเตเดเตโเดฎเตเดจเตเดฑเต เดเดกเดจเตเดฑเดฟเดซเดฏเตผ aaaa (เดเดตเดฟเดเต _ เดถเตเดจเตเดฏเดฎเดพเดฏเดคเดฟเดจเต เดชเตเดฐเดคเดฟเดจเดฟเดงเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต)
ALTa เดเดคเดฐ เดเตเตบเดซเตเตผเดฎเตเดทเตป a
ATOMaaaa
เดเดฑเตเดฑเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดชเตเดฐเต aaaa (เดเดตเดฟเดเต _ เดถเตเดจเตเดฏเดฎเดพเดฏเดคเดฟเดจเต เดชเตเดฐเดคเดฟเดจเดฟเดงเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต) (เดเดฒเตเดฒเดพ 4 เดชเตเดฐเดคเตเดเดเตเดเดณเตเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเดพเตฝ H เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเด
ATOM_H__)
RESaaa เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเด aaa
# เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเด #
#เดเดฐเต เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเด #, เดคเดฟเดฐเตเดเตเด a
#-# เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดถเตเดฐเตเดฃเดฟ # (เดเตปเดธเตเตผเดเตเดเต เดเตเดกเตเดเตพ เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเต)
เดเดฐเต เด เดเตเดทเดฐ เดเตเดกเตเดเดณเดพเตฝ เดเดฐเต เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดคเดฐเด (เดเดฆเดพ. y)
aaa เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดคเดฐเด เดฎเตเดจเตเดจเต เด เดเตเดทเดฐ เดเตเดกเตเดเดณเดพเตฝ (เดเดฆเดพ. เดเตเตผ)
เดเดฒเตเดฒเดพเด, เดชเตเดฐเตเดเตเดเตเตป, MC, SC, เดฌเตเดธเต, เดเตฝเดซ, เดฌเตเดฑเตเดฑ, เดจเตเดเตเดฐเดเตป, เดเดพเตผเดฌเตบ,
เดเดเตเดธเดฟเดเตป, เดธเตพเดซเตผ, เดซเตเดธเตเดซเดฑเดธเต, เดนเตเดกเตเดฐเดเตป, เดฒเตเดนเด, เดชเตเดณเดพเตผ,
เดจเตเตบเดชเตเดณเดพเตผ, เดเดพเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดค, เดฆเดพเดคเดพเดตเต, เดธเตเดตเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดฏเดพเตพ, เดเดฐเตเดฎเดพเดฑเตเดฑเดฟเดเต, เดฎเตเดฅเตเตฝ, HET, เดตเดพเดเตเดเตผ, เดกเดฟเดเตปเด, เดเตผเดเตปเด
เดเดฒเตเดฒเดพ เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดเดฑเตเดฑเดเตเดเดณเตเดเต เดเดฐเต เดเดชเดตเดฟเดญเดพเดเด
OLT# เดคเดพเดฎเดธเด # (เดชเตเตผเดฃเตเดฃเดธเดเดเตเดฏ เดถเดคเดฎเดพเดจเด)
OGT# เดเดเตเดฏเตเดชเตปเดธเดฟ # (เดชเตเตผเดฃเตเดฃเดธเดเดเตเดฏ เดถเดคเดฎเดพเดจเด)
BLT# B-เดฎเตเดฒเตเดฏเด #-เตฝ เดคเดพเดดเต (เดชเตเตผเดฃเตเดฃเดธเดเดเตเดฏ)
BGT# B-เดฎเตเดฒเตเดฏเด #-เดจเตเดเตเดเดพเตพ เดตเดฒเตเดคเต (เดชเตเตผเดฃเตเดฃเดธเดเดเตเดฏ)
INSa เดเตเดกเต เด เดเตเตผเดเตเดเตเด (เดเดตเดฟเดเต _ เดถเตเดจเตเดฏเดฎเดพเดฏเดคเดฟเดจเต เดชเตเดฐเดคเดฟเดจเดฟเดงเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต)
#.# เดจเตเดฑเต #.#, #.#, #.#
เดชเตเดฏเดฟเดจเตเดฑเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เด เดเดฒเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดณเตเดณ เดเดฑเตเดฑเดเตเดเตพ
เดชเดพเดฑเตเดฑเตเดฃเตเดเตพ "trp,phe, tyr" เด เตผเดคเตเดฅเด เดชเตเดฒเตเดฏเตเดณเตเดณ เดเตเดฎ เดตเตเตผเดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดฒเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเตเดเดณเดพเดฏเดฟ เดธเดเดฏเตเดเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดพเด
TRP เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ PHE เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ TYR.
เดถเตเดจเตเดฏเดคเดเดณเดพเตฝ เดตเตเตผเดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดชเดพเดฑเตเดฑเตเดฃเตเดเตพ เดเดฒเตเดฒเดพเด เดถเดฐเดฟเดฏเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด, เด เดคเดพเดฏเดคเต "เดเตเดฏเดฟเตปเดฌเต 1-5" เด เตผเดคเตเดฅเด
เดฌเดฟ เดเตเดฏเดฟเตป 1 เดฎเตเดคเตฝ 5 เดตเดฐเตเดฏเตเดณเตเดณ เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเดเตเดเตพ.
เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเต เดชเดฐเดพเดจเตเดคเตเดธเดฟเดธเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดชเดพเดฑเตเดฑเตเดฃเตเดเตพ เดเตเดฐเตเดชเตเดชเตเดเตเดฏเตเดฏเดพเดจเตเด | เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดชเดพเดฑเตเดฑเตเดฃเตเดเตพ เดตเตเตผเดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดพเดจเตเด เดเดดเดฟเดฏเตเด
'เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ' เดเดจเตเดจเตผเดคเตเดฅเด เดเตเดเดพเดคเต "เดจเตเดเตเดเต เดซเดฏเตฝ1" เดเดจเตเดจเดคเดฟเดฒเต เดชเตเดฒเต NOT เดเดจเตเดจ เดชเตเดฐเดเด เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดเตเดเตเด
เดซเดฏเตฝ 1.
เดเดฐเต autobondrot เดซเดฏเตฝ เดฎเดฑเตเดฑเต PDB เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดซเดฏเดฒเตเดเตพเดเตเดเต เดธเดฎเดพเดจเดฎเดพเดฃเต เดเดจเตเดจเดพเตฝ เด เดคเดฟเตฝ เดตเดฟเดตเดฐเดเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต
เดญเตเดฐเดฎเดฃเดเตเดเตพเดเตเดเตเด เดฎเดฑเตเดฑเต เดชเดฐเดฟเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดเตพเดเตเดเตเด เดตเดฟเดงเตเดฏเดฎเดพเดฏ เดเดฑเตเดฑเดเตเดเดณเต เดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฑเดฟเดฏเตเดจเตเดจเต.
เดเดพเตฝเดซ-เดธเดฟเดฌเตเดฑเตเดฑ เดฌเตเดฃเตเดเต เดฑเตเดเตเดเตเดทเดจเตเด เดเดจเตเดเดพเดฒเดฟเดเดตเตเด เดเดพเดฃเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดเดเตเดเตเดฌเตเตบเดกเตเดฐเตเดเตเดเต เดซเดฏเตฝ เดถเดเดฒเด เดเดฆเดพเดนเดฐเดฃเด
เด เดญเตเดฐเดฎเดฃเดคเตเดคเดฟเดจเต เดเตเตผเดทเตป เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ เดซเดเดเตโเดทเตป
ATOM 1 CB TYR 61 34.219 17.937 4.659 1.00 0.00
เดฌเตเดฃเตเดเตเดฐเตเดเตเดเต:เดเดฟ1:78.7:
0:359:5:33.138:18.517: 5.531:34.219:17.937: 4.659
เดตเดฟเดฒ:-3:60:3: ATOM 1 1HB TYR 61 34.766 18.777 4.206 1.00 0.00
ATOM 1 2HB TYR 61 34.927 17.409 5.315 1.00 0.00 ATOM 1 CG
TYR 61 33.836 16.989 3.546 1.00 0.00 ...
เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ เดตเตเตผเดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดเตเดเตเดฌเตเตบเดกเตเดฐเตเดเตเดเต เดเดฎเดพเตปเดกเตเดเตพ เดเตเดณเดฃเตเดเตพ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดชเดฐเดฟเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดเตพ:
BONDROT:id:currAng:start:end:stepSz:x1:y1:z1:x2:y2:z2
TRANS: id:currpos:start:end:stepSz:x1:y1:z1:x2:y2:z2
NULL # เดกเดฎเตเดฎเดฟ
เดชเดเตเดทเดชเดพเดค เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดเตพ:
COS:scale:phaseOffset:frequency POLY:scale:offset:polynomialDegree CONST:value
เดถเดพเดเดเตพ:
เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเต เดชเตเดจเดเดธเตเดฅเดพเดชเดฟเดเตเดเตเด เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ "(" เดเตเดเดพเดคเต ")"
(เดเดฆเดพ. เดเดฐเต เดเดฟเดฏเตเด เดเดธเตเดฒเตเดธเดฟเดจเดฟเดจเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดฎเตเดฅเตเดฒเตเดเดณเตเด เดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเด
เดเตเดฐเดฎเด เดเดคเดพเดฃเต: rotChi1/SAVE/rotChi2/rotCD1/RESTORE/rotCG2)
เดเดฑเดฟเดฏเดจเตเดฑเตเดทเตป เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด: GO:angle1:angle2:... เดซเดฏเดฒเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด: @filename เด เดญเดฟเดชเตเดฐเดพเดฏเดเตเดเตพ:
# เดเดฎเดจเตเดฑเต เดเตเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเต
เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเด: เดชเดคเดฟเดชเตเดชเต 2.13.110909, เดชเดเตผเดชเตเดชเดตเดเดพเดถเด 1996-2011, เดเต. เดฎเตเดเตเดเตฝ เดตเตเดกเต
onworks.net เดธเตเดตเดจเดเตเดเตพ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดเดฟเดเดเต-เดชเตเดฐเตเดฌเต เดเตบเดฒเตเดจเดพเดฏเดฟ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด