macs2_bdgopt - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

macs2_bdgopt - ചിപ്പ്-സീക്വൻസിംഗിനായുള്ള മോഡൽ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള വിശകലനം

വിവരണം

ഉപയോഗം: macs2 bdgopt [-h] -i IFILE [-m {multiply, add,p2q}]

[-p [എക്‌സ്‌ട്രാപാരം [എക്‌സ്‌ട്രാപാരം ...]]] [--ഔട്ട്ഡിർ ഔട്ട്ഡിർ] -o
ഫയൽ

ഓപ്ഷണൽ വാദങ്ങൾ:
-h, --സഹായിക്കൂ
ഈ സഹായ സന്ദേശം കാണിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക

-i IFILE, --ifile IFILE
ബെഡ്ഗ്രാഫിൽ MACS സ്കോർ. ശ്രദ്ധിക്കുക: ഇത് മുഴുവൻ ഉൾക്കൊള്ളുന്ന ഒരു ബെഡ്ഗ്രാഫ് ഫയൽ ആയിരിക്കണം
ജനിതകഘടന. ആവശ്യമാണ്

-m {multiply, add,p2q}, --രീതി {ഗുണനം, ചേർക്കുക, p2q}
ബെഡ്‌ഗ്രാഫ് ഫയലിന്റെ സ്‌കോർ കോളം പരിഷ്‌ക്കരിക്കുന്നതിനുള്ള രീതി. ലഭ്യമായ തിരഞ്ഞെടുപ്പുകൾ ഇവയാണ്:
ഗുണിക്കുക, ചേർക്കുക അല്ലെങ്കിൽ p2q. 1) ഗുണിക്കുക, EXTRAPARAM ആവശ്യമാണ്, അത് ആയിരിക്കും
സ്കോർ കോളത്തിലേക്ക് ഗുണിച്ചു. നിങ്ങൾ സ്കോർ കോളത്തെ X കൊണ്ട് ഹരിക്കാൻ ഉദ്ദേശിക്കുന്നുവെങ്കിൽ, ഉപയോഗിക്കുക
1/X ന്റെ മൂല്യം EXTRAPARAM ആയി. 2) ചേർക്കുക, EXTRAPARAM ആവശ്യമാണ്, ഒപ്പം ചേർക്കും
സ്കോർ കോളം. നിങ്ങൾ സ്കോർ കോളം X കൊണ്ട് കുറയ്ക്കാൻ ആഗ്രഹിക്കുന്നുവെങ്കിൽ, മൂല്യം ഉപയോഗിക്കുക -X
എക്സ്ട്രാപാരം ആയി. 3) p2q, ഇത് p-value സ്കോറുകളെ q-value സ്കോറുകളാക്കി മാറ്റും
ബെഞ്ചമിനി-ഹോച്ച്ബെർഗ് പ്രക്രിയ. EXTRAPARAM ആവശ്യമില്ല. ഈ രീതി അനുമാനിക്കുന്നു
സ്കോറുകൾ ആകുന്നു -ലോഗ് 10 MACS2-ൽ നിന്നുള്ള p-മൂല്യം. മറ്റേതെങ്കിലും തരത്തിലുള്ള സ്കോർ കാരണമാകും
അപ്രതീക്ഷിത പിശകുകൾ.

-p [എക്‌സ്‌ട്രാപാരം [എക്‌സ്‌ട്രാപാരം ...]], --അധിക-പാരം [എക്‌സ്‌ട്രാപാരം [എക്‌സ്‌ട്രാപാരം ...]]
METHOD-നുള്ള അധിക പാരാമീറ്റർ. എന്നതിന്റെ വിശദാംശങ്ങൾ പരിശോധിക്കുക -m ഓപ്ഷൻ.

--പുറം പുറത്ത്
വ്യക്തമാക്കിയാൽ എല്ലാ ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയലുകളും ആ ഡയറക്‌ടറിയിലേക്ക് എഴുതപ്പെടും. സ്ഥിരസ്ഥിതി: the
നിലവിലെ പ്രവർത്തന ഡയറക്ടറി

-o ഫയൽ, --ofile ഫയൽ
ഔട്ട്പുട്ട് BEDGraph ഫയൽനാമം.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് macs2_bdgopt ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക