പ്രൈമേഴ്‌സ് - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

പ്രൈമറുകൾ - PCR പ്രൈമറുകൾ തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിനുള്ള പ്രൈമർ3 ന്റെ ലളിതമായ പതിപ്പ്

സിനോപ്സിസ്

പ്രൈമറുകൾ - ക്രമം തുടർച്ചയായി [-ലക്ഷ്യം പ്രദേശം ശ്രേണി] [- ചെറുതാക്കുക പൂർണ്ണസംഖ്യ] [- പരമാവധി പൂർണ്ണസംഖ്യ]
[-maxdifftm ഫ്ലോട്ട്] [-പതാക വിശദീകരിക്കുക ബൂളിയൻ] [-സംഖ്യ റിട്ടേൺ പൂർണ്ണസംഖ്യ] - outfile ഔട്ട്ഫിൽ

പ്രൈമറുകൾ -ഹെൽപ്പ്

വിവരണം

പ്രൈമറുകൾ EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ
സോഫ്റ്റ്‌വെയർ സ്യൂട്ട്"). ഇത് "Nucleic:Primers" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിന്റെ(കളുടെ) ഭാഗമാണ്.

ഓപ്ഷനുകൾ

ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
- ക്രമം തുടർച്ചയായി
പ്രൈമറുകൾ തിരഞ്ഞെടുക്കേണ്ട ക്രമം. ക്രമം 5' -> 3' ഹാജരാക്കണം

അധികമായ വിഭാഗം
-ലക്ഷ്യം പ്രദേശം ശ്രേണി
ഒന്നോ അതിലധികമോ ടാർഗെറ്റുകൾ വ്യക്തമാക്കിയിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, ഒരു നിയമപരമായ പ്രൈമർ ജോഡി കുറഞ്ഞത് ഒരെണ്ണമെങ്കിലും ഉണ്ടായിരിക്കണം
അവരിൽ. ഒരു ടാർഗെറ്റ് ഒരു ലളിതമായ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് സൈറ്റായിരിക്കാം (ഉദാഹരണത്തിന് ഒരു CA ആവർത്തനം) അല്ലെങ്കിൽ
ഒറ്റ-അടിസ്ഥാന-ജോഡി പോളിമോർഫിസം. മൂല്യം എന്നതിന്റെ സ്‌പെയ്‌സ് വേർതിരിച്ച ലിസ്റ്റായിരിക്കണം
, ജോഡി എവിടെ ഒരു ലക്ഷ്യത്തിന്റെ ആദ്യ അടിത്തറയുടെ സൂചികയാണ്, കൂടാതെ
അവസാനത്തെ ഉദാ 50,51 ആണ് 2 സ്ഥാനങ്ങളിലെ 50 ബേസുകളെ ചുറ്റാൻ പ്രൈമറുകൾ ആവശ്യമാണ്
ഒപ്പം 51.

- ചെറുതാക്കുക പൂർണ്ണസംഖ്യ
ഒരു പ്രൈമറിന്റെ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ സ്വീകാര്യമായ ദൈർഘ്യം. 0-നേക്കാൾ വലുതും അതിൽ കുറവോ തുല്യമോ ആയിരിക്കണം
MAX-SIZE വരെ. സ്ഥിര മൂല്യം: 18

- പരമാവധി പൂർണ്ണസംഖ്യ
ഒരു പ്രൈമറിന്റെ പരമാവധി സ്വീകാര്യമായ നീളം (അടിസ്ഥാനങ്ങളിൽ). നിലവിൽ ഈ പരാമീറ്റർ ആകാൻ കഴിയില്ല
35-നേക്കാൾ വലുത്. ഈ പരിധി നിയന്ത്രിക്കുന്നത് പ്രൈമർ3യുടെ പരമാവധി ഒലിഗോ വലുപ്പമാണ്
ഉരുകൽ-താപനില സാധുവാണ്. സ്ഥിര മൂല്യം: 27

-maxdifftm ഫ്ലോട്ട്
ഉരുകൽ താപനിലകൾ തമ്മിലുള്ള പരമാവധി സ്വീകാര്യമായ (ഒപ്പ് ചെയ്യാത്ത) വ്യത്യാസം
ഫോർവേഡ്, റിവേഴ്സ് പ്രൈമറുകൾ. സ്ഥിര മൂല്യം: 100.0

ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
-പതാക വിശദീകരിക്കുക ബൂളിയൻ
ഈ ഫ്ലാഗ് നോൺ-0 ആണെങ്കിൽ, LEFT-EXPLAIN, RIGHT-EXPLAIN, ഔട്ട്‌പുട്ട് എന്നിവ നിർമ്മിക്കുക.
Primer3 പരിശോധിച്ച പ്രൈമർ ജോഡികളുടെ എണ്ണത്തെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ നൽകാൻ ഉദ്ദേശിച്ചുള്ളതാണ്,
വിവിധ കാരണങ്ങളാൽ നിരസിച്ച സംഖ്യയുടെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകളും. സ്ഥിര മൂല്യം: എൻ

-സംഖ്യ റിട്ടേൺ പൂർണ്ണസംഖ്യ
തിരികെ നൽകേണ്ട പ്രൈമർ ജോഡികളുടെ പരമാവധി എണ്ണം. തിരികെ നൽകിയ പ്രൈമർ ജോഡികൾ ക്രമീകരിച്ചിരിക്കുന്നു
അവയുടെ 'ഗുണനിലവാരം', മറ്റൊരു വിധത്തിൽ പറഞ്ഞാൽ ഒബ്ജക്റ്റീവ് ഫംഗ്‌ഷന്റെ മൂല്യം (ഇവിടെ ഒരു താഴ്ന്നത്
നമ്പർ ഒരു മികച്ച പ്രൈമർ ജോഡിയെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു). മുന്നറിയിപ്പ്: ഈ പരാമീറ്റർ വലുതായി സജ്ജമാക്കുക
മൂല്യം പ്രവർത്തന സമയം വർദ്ധിപ്പിക്കും. സ്ഥിര മൂല്യം: 5

- outfile ഔട്ട്ഫിൽ

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് പ്രൈമേഴ്സ് ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക