BLAST Ring Image Generator എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് BRIG-0.95-dist.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
BLAST Ring Image Generator എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
BLAST റിംഗ് ഇമേജ് ജനറേറ്റർ
വിവരണം
ജീനോം അസംബ്ലി ഡാറ്റ കൈകാര്യം ചെയ്യുന്നതിൽ ശ്രദ്ധ കേന്ദ്രീകരിച്ച് ധാരാളം ജീനോമുകൾക്കിടയിൽ വൃത്താകൃതിയിലുള്ള താരതമ്യങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന ഒരു ക്രോസ്-പ്ലാറ്റ്ഫോം (വിൻഡോസ്/മാക്/യുണിക്സ്) ആപ്ലിക്കേഷനാണ് BRIG.പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളുടെ കണക്കുകൾ സൃഷ്ടിക്കാൻ BRIG ഉപയോഗിക്കുകയാണെങ്കിൽ BRIG പേപ്പർ ഉദ്ധരിക്കുക: NF അലിഖാൻ, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): ലളിതമായ പ്രോകാരിയോട്ട് ജീനോം താരതമ്യങ്ങൾ, BMC ജീനോമിക്സ്, 12:402. PMID: 21824423
സവിശേഷതകൾ
- സെൻട്രൽ റഫറൻസ് സീക്വൻസും മറ്റ് സീക്വൻസുകളും കോൺസെൻട്രിക് വളയങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള സാമ്യം ചിത്രങ്ങൾ കാണിക്കുന്നു.
- BRIG എല്ലാ BLAST താരതമ്യങ്ങളും ഒരു ലളിതമായ GUI വഴി യാന്ത്രികമായി ഫയൽ പാഴ്‌സിംഗ് നടത്തും.
- ഡ്രാഫ്റ്റ് ജീനോമുകൾക്കായി കോൺടിഗ് ബൗണ്ടറികളും റീഡ് കവറേജും പ്രദർശിപ്പിക്കാൻ കഴിയും; ഇഷ്ടാനുസൃതമാക്കിയ ഗ്രാഫുകളും വ്യാഖ്യാനങ്ങളും പ്രദർശിപ്പിക്കാൻ കഴിയും.
- ഇൻപുട്ടായി ഉപയോക്താവ് നിർവചിച്ചിരിക്കുന്ന ജീനുകളുടെ ഒരു കൂട്ടം ഉപയോഗിക്കുന്നതിലൂടെ, BRIG-ന് പൂർണ്ണമായ ജീനോമുകൾ, ഡ്രാഫ്റ്റ് ജീനോമുകൾ അല്ലെങ്കിൽ അസംസ്‌കൃത, അസംബ്ലിഡ് സീക്വൻസ് ഡാറ്റ എന്നിവയിൽ ജീൻ സാന്നിധ്യം, അഭാവം, വെട്ടിച്ചുരുക്കൽ അല്ലെങ്കിൽ ക്രമ വ്യതിയാനം എന്നിവ പ്രദർശിപ്പിക്കാൻ കഴിയും.
- ഒന്നിലധികം സാമ്പിളുകളിൽ നിന്നുള്ള അസംബ്ലിംഗ് സീക്വൻസ് ഡാറ്റയിൽ ഉള്ള ജീനോമിക് മേഖലകളെ ഒരേസമയം താരതമ്യം ചെയ്യാൻ പ്രാപ്തമാക്കുന്ന SAM- ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത റീഡ്-മാപ്പിംഗ് ഫയലുകളും BRIG സ്വീകരിക്കുന്നു.
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
ജാവ
ഇത് https://sourceforge.net/projects/brig/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
