Ini ialah arahan bowtie2-inspect yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
bowtie2-inspect - pembalut untuk bowtie2-inspect-* indeks
SINOPSIS
bowtie2-periksa [pilihan]*
DESCRIPTION
Bowtie 2 versi 2.2.6 oleh Ben Langmead ([e-mel dilindungi], www.cs.jhu.edu/~langmea)
nama fail bt2 tolak mengekor .1.bt2/.2.bt2
Secara lalai, mencetak rekod FASTA bagi jujukan nukleotida yang diindeks kepada standard
keluar. Dengan -n, hanya mencetak nama. Dengan -s, hanya mencetak ringkasan indeks
parameter dan urutan. Dengan -e, mengekalkan warna jika berkenaan.
PILIHAN
--indeks besar
paksa pemeriksaan indeks 'besar', walaupun indeks 'kecil' ada.
-a/--seberang
Bilangan aksara merentas dalam output FASTA (lalai: 60)
-n/--nama
Cetak nama jujukan rujukan sahaja
-s/--ringkasan
Ringkasan cetakan termasuk. nama ref, panjang, sifat indeks
-e/--bt2-ref
Bina semula rujukan daripada .bt2 (lambat, mengekalkan warna)
-v/--berkata-kata
Output verbose (untuk nyahpepijat)
-h/--bantuan
cetak penerangan terperinci tentang alat dan pilihannya
- membantu cetak mesej penggunaan ini
Gunakan bowtie2-inspect dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
