Ini ialah arahan cmtk-groupwise_affine yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
groupwise_affine - pendaftaran penduduk Affine
SINOPSIS
groupwise_affine [pilihan] imej0 [imej1 ...]
DESCRIPTION
Alat ini mendaftarkan populasi imej input secara serentak, tanpa templat, menggunakan
sama ada algoritma 'congealing' atau ukuran persamaan mengikut kumpulan berdasarkan berterusan
penghampiran maklumat bersama ('RMI').
PILIHAN
Global Toolkit Pilihan (ini adalah dikongsi by semua CMTK alatan)
- membantu
Tulis senarai pilihan baris arahan asas kepada output standard.
--bantu-semua
Tulis senarai lengkap pilihan baris perintah asas dan lanjutan kepada output standard.
--wiki
Tulis senarai pilihan baris arahan kepada output standard dalam penanda MediaWiki.
--lelaki
Tulis sumber halaman manual dalam penanda 'nroff' kepada output standard.
--versi
Tulis versi kit alat kepada output standard.
--gema
Tulis baris arahan semasa kepada output standard.
--peringkat-verbose
Tetapkan tahap verbositi.
--verbose, -v
Naikkan tahap verbositi sebanyak 1 (ditamatkan; disokong untuk keserasian ke belakang).
--benang
Tetapkan bilangan maksimum utas selari (untuk utas POSIX dan OpenMP).
Pendaftaran metrik Pilihan
--rmi
Gunakan metrik RMI (aka maklumat bersama serantau) untuk memacu pendaftaran).
--sejuk
Gunakan algoritma congealing menggunakan entropi tindanan mengikut piksel untuk memacu
pendaftaran. [Ini is yang lalai]
Templat Image Pilihan
--template , -t
Masukkan nama fail untuk imej templat yang dipratakrifkan. [Lalai: TIADA]
--template-dengan-data , -T
Gunakan data piksel imej templat yang dibekalkan pengguna dalam pendaftaran [Lalai: kurang upaya]
Output Pilihan
--output-root , -O
Direktori akar untuk semua fail output. [Lalai: TIADA]
--pengeluaran , -o
Nama fail keluaran untuk arkib pendaftaran mengikut kumpulan. [Lalai: mengikut kumpulan.xforms ]
--output-purata
Nama fail keluaran untuk imej purata berdaftar. [Lalai: purata.nii ]
--purata-linear
Gunakan interpolasi linear untuk imej purata [Ini is yang lalai]
--purata-kubik
Gunakan interpolasi padu untuk imej purata
--tiada-output-purata
Jangan tulis imej biasa.
Pelbagai resolusi Parameter
--downsample-daripada , -d
Faktor pensampelan awal [Lalai: 4]
--downsample-kepada , -D
Faktor pensampelan akhir. [Lalai: 1]
--pensampelan-ketumpatan , -s
Ketumpatan pensampelan kebarangkalian. Nilai undang-undang antara 0 dan 1. [Lalai: kurang upaya]
Image Pilihan and operasi
--force-background , -B
Paksa piksel latar belakang (di luar FOV) kepada nilai (bin) yang diberikan. [Lalai: kurang upaya]
--histogram-tong , -H
Tetapkan bilangan tong histogram secara manual untuk penilaian entropi [Lalai: kurang upaya]
--histogram tanaman
Pangkas histogram imej untuk menggunakan tong histogram dengan lebih baik.
--licin
Sigma kernel pelicinan Gaussian dalam gandaan saiz piksel imej templat.
[Lalai: kurang upaya]
--padanan-histogram
Padankan semua histogram imej dengan data templat (atau imej pertama, jika tiada imej templat
diberikan)
--percuma-dan-baca semula
Memori percuma diperuntukkan untuk imej asal apabila ini tidak diperlukan dan dibaca semula
fail imej mengikut keperluan. Ini boleh berguna apabila berjalan pada mesin dengan terhad
sumber ingatan.
Transformasi Parameter
--dofs [, ,...]
Tambahkan DOF ke senarai [lalai: satu laluan, 6 DOF]
--sifar-jumlah, -z
Menguatkuasakan pengiraan jumlah sifar.
--kumpulan-biasa-dahulu-n , -N
Imej N pertama adalah daripada kumpulan biasa dan harus didaftarkan tanpa berat sebelah.
[Lalai: 0]
--sifar-jumlah-pertama-n , -Z
Kuatkuasakan pengiraan jumlah sifar untuk imej N pertama. [Lalai: kurang upaya]
Transformasi Pengawalan
--align-bounding-boxes
Pada mulanya selaraskan pusat kotak sempadan semua imej dengan terjemahan [Ini is yang
lalai]
--menjajarkan-pusat-jisim
Pada mulanya menyelaraskan pusat jisim dengan terjemahan
--init-scales
Mulakan faktor skala menggunakan momen tertib pertama
Pengoptimuman Parameter
--penerokaan , -e
Penerokaan pengoptimuman dalam piksel [Lalai: 0.25]
--ketepatan , -a
Ketepatan pengoptimuman dalam piksel [Lalai: 0.01]
--peringkat ulangan , -r
Bilangan ulangan setiap tahap pengoptimuman [Lalai: 5]
--faktor-langkah , -S
Faktor langkah untuk pas pengoptimuman berturut-turut [Lalai: 0.5]
--delta-f-ambang
Ambang pilihan untuk menamatkan pengoptimuman (tahap) jika perubahan relatif sasaran
fungsi jatuh di bawah nilai ini. [Lalai: 0]
--disable-optimization
Lumpuhkan pengoptimuman dan konfigurasi awal output.
PENGARANG
Torsten Rohlfing, dengan sumbangan daripada Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, dan Yaroslav Halchenko
Gunakan cmtk-groupwise_affine dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
