cmtk-imagemath - Dalam Talian di Awan

JADUAL:

NAMA

imagemath - Operasi imej

DESCRIPTION

Lakukan operasi pada imej menggunakan tatatanda postfix berasaskan tindanan.

Imej boleh dibaca daripada fail dan ditolak ke tindanan. Imej pada timbunan boleh
diproses dan digabungkan melalui pengendali yang berbeza. Keputusan semua operasi diletakkan semula
ke dalam timbunan, di mana ia boleh diproses selanjutnya atau ditulis kembali ke fail imej.

PILIHAN

Global Toolkit Pilihan (ini adalah dikongsi by semua CMTK alatan)
- membantu
Tulis senarai pilihan baris arahan asas kepada output standard.

--bantu-semua
Tulis senarai lengkap pilihan baris perintah asas dan lanjutan kepada output standard.

--wiki
Tulis senarai pilihan baris arahan kepada output standard dalam penanda MediaWiki.

--lelaki
Tulis sumber halaman manual dalam penanda 'nroff' kepada output standard.

--versi
Tulis versi kit alat kepada output standard.

--gema
Tulis baris arahan semasa kepada output standard.

--peringkat-verbose
Tetapkan tahap verbositi.

--verbose, -v
Naikkan tahap verbositi sebanyak 1 (ditamatkan; disokong untuk keserasian ke belakang).

--benang
Tetapkan bilangan maksimum utas selari (untuk utas POSIX dan OpenMP).

Input / output operasi
--dalam
Baca imej input ke bahagian atas tindanan

--keluar
Tulis imej output dari atas timbunan (tetapi biarkan pada timbunan)

--set-padding-value
Tetapkan nilai yang ditafsirkan sebagai nilai padding dalam imej yang dibaca kemudiannya.

--unset-padding
Lumpuhkan padding. Semua nilai dalam imej yang dibaca kemudiannya akan ditafsirkan sebagai sebenar
data.

Dalaman tetapan
--terapung
Gunakan ketepatan tunggal untuk pengiraan dan keputusan [Ini is yang lalai]

--berganda
Gunakan ketepatan berganda untuk pengiraan dan keputusan

Menumpukkan operasi
--pop
Pop (buang) imej atas daripada timbunan.

--menipu
Imej pendua di atas timbunan.

--semua
Gunakan operasi imej tunggal seterusnya pada semua imej pada tindanan.

Imej tunggal pengendali
--isi
Isi imej teratas dengan nilai tetap (iaitu, tetapkan nilai kepada semua piksel)

--abs
Gunakan fungsi abs() pada imej atas

--log
Gunakan fungsi log() pada imej atas

--logit
Gunakan fungsi log(x/(1-x)) pada imej atas

--logistik
Gunakan 1/(1+exp(-x)) fungsi pada imej atas

--exp
Gunakan fungsi exp() pada imej atas

--sqr
Gunakan operator segi empat sama pada imej atas

--sqrt
Gunakan operator punca kuasa dua pada imej atas

--trunc
Potong semua nilai dalam imej teratas kepada integer

--satu-lebih
Untuk setiap piksel, gantikan nilainya x dengan 1.0/x

--scalar-mul
Darabkan imej teratas dengan nilai skalar

--skalar-tambah
Tambahkan skalar pada setiap piksel imej teratas

--scalar-xor
Eksklusif bitwise-atau antara tahap atas dan nilai skalar yang diberikan

--skalar-dan
Bitwise dan operasi antara peringkat atas dan nilai skalar yang diberikan

--mengirik-di bawah
Tetapkan nilai di bawah ambang yang diberikan kepada ambang.

--mengirik-di atas
Tetapkan nilai di atas ambang yang diberikan kepada ambang.

Image pasangan pengendali
--Tambah
Tambah imej atas dan kedua, letakkan hasil pada tindanan

--mul
Darabkan imej atas dan kedua, letakkan hasil pada tindanan

--div
Bahagikan imej atas dengan imej kedua, letakkan hasil pada tindanan

--atan2
Hitung fungsi atan2() daripada tup dua pasangan piksel imej, letakkan hasil pada tindanan

--padanan-histogram
Skala keamatan dalam satu imej untuk memadankan keamatan imej lain. Imej terakhir ditolak
ke timbunan menyediakan taburan keamatan rujukan, imej sebelumnya
akan diubah suai. Kedua-dua imej input dikeluarkan daripada timbunan dan imej yang diubah suai
ditolak ke atas timbunan.

--match-min-sdev
Skala keamatan satu imej untuk memadankan min dan sisihan piawai bagi imej lain. The
imej terakhir ditolak ke tindanan menyediakan taburan intensiti rujukan, yang
imej sebelumnya akan diubah suai. Kedua-dua imej input dikeluarkan daripada timbunan dan
imej yang diubah suai ditolak ke tindanan.

--padanan-min-sdev3
Skala keamatan imej dengan faktor dan mengimbangi dikira daripada dua imej lain
untuk memadankan min dan sisihan piawai mereka. Imej terakhir ditolak ke timbunan
menyediakan taburan keamatan rujukan, imej sebelumnya menyediakan
taburan intensiti untuk dipadankan dengan imej rujukan, dan imej ketiga pada
timbunan akan diubah suai. Ketiga-tiga imej input dikeluarkan daripada timbunan dan
imej yang diubah suai ditolak ke tindanan.

--purata topeng
Purata topeng: imej teratas diambil sebagai topeng berbilang label. Piksel dalam
imej kedua dipuratakan oleh label topeng, dan kemudian digantikan dengan nilai purata
untuk setiap label topeng.

Kompleks Aritmetik
--kompleks-div
Pembahagian kompleks, (a+ib)/(c+id), dengan mengandaikan empat nilai diletakkan pada timbunan mengikut urutan
a, b, c, d. Letakkan hasil pada tindanan, nyata pertama, khayalan kedua (iaitu, khayalan ialah
atas).

Operator Bahawa kontrak yang keseluruhan timbunan ke dalam a tunggal gambar
--jumlah
Jumlahkan semua imej pada tindanan, letakkan hasil pada tindanan

--produk
Kira produk semua imej pada tindanan, letakkan hasil pada tindanan

--purata
Purata semua imej pada tindanan, letakkan hasil pada tindanan

--variance
Untuk setiap piksel, hitung varians ke atas semua imej pada tindanan, letakkan hasil pada tindanan

--combine-pca
Gabungkan imej menggunakan PCA dengan menayang ke arah korelasi terbesar

--nilai-maks
Untuk setiap piksel, kira VALUE maksimum ke atas semua imej, letakkan hasil pada tindanan

--nilai-min
Untuk setiap piksel, kira NILAI minimum ke atas semua imej, letakkan hasil pada tindanan

--maks-indeks
Untuk setiap piksel, hitung INDEX imej dengan nilai maksimum, letakkan hasil pada tindanan

Operator Bahawa kontrak a timbunan of label imej ke dalam a tunggal label gambar
--undi
Gabungkan semua imej pada tindanan dengan undian, letakkan hasil pada tindanan

--ruji
Gabungkan peta binari pada tindanan menggunakan lelaran [arg] algoritma STAPLE. The
hasil daripada operasi ini ialah peta spatial 'berat' W, iaitu
kebarangkalian latar depan imej pada setiap piksel. Dalam mod 'verbose', anggaran pakar
parameter p (kepekaan) dan q (kekhususan) juga ditulis kepada output standard.

--label-kontrak
Kontrak berbilang peta label menjadi satu dengan memilih yang pertama (atas semua imej pada
tindanan) bukan sifar label pada setiap piksel

--mstaple
Gabungkan peta berbilang label pada tindanan menggunakan lelaran [arg] berbilang kelas
Algoritma STAPLE. Hasil operasi ini adalah gabungan kemungkinan maksimum
peta berbilang label.

--mstaple-dipertikaikan
Seperti operasi sebelumnya, gunakan algoritma STAPLE berbilang kelas, tetapi hadkan pengiraan
kepada voxel 'dipertikaikan', iaitu, voxel yang dipetakan label input tidak bersetuju. Ini selalunya
menambah baik hasil dengan mengurangkan, cth, kesan latar belakang.

--stack-entropy-labels
Kira entropi tindanan pada setiap piksel daripada imej input integer (label).

PENGARANG

Torsten Rohlfing, dengan sumbangan daripada Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, dan Yaroslav Halchenko

Gunakan cmtk-imagemath dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net