Ini ialah arahan cpgreporte yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
cpgreport - Kenal pasti dan laporkan kawasan kaya CpG dalam jujukan nukleotida
SINOPSIS
cpgreport -urutan seqall -skor integer -fail luar fail luar -kekalahan featout
cpgreport -membantu
DESCRIPTION
cpgreport ialah program baris arahan daripada EMBOSS (“The European Molecular Biology Open
Suite Perisian”). Ia adalah sebahagian daripada kumpulan arahan "Nukleik:CpG Islands".
PILIHAN
Input seksyen
-urutan seqall
diperlukan seksyen
-skor integer
Ini menetapkan skor untuk setiap jujukan CG yang ditemui. Nilai 17 adalah lebih sensitif, tetapi
28 juga telah digunakan dengan sedikit kejayaan. Nilai lalai: 17
Output seksyen
-fail luar fail luar
-kekalahan featout
Fail untuk ciri output
Gunakan cpgreporte dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
