Ini ialah arahan fpromlke yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
fpromlk - Filogeni protein mengikut kemungkinan maksimum
SINOPSIS
fpromlk -urutan seqsetall -intreefile pokok [-kategori integer] -kadar pelbagai
-kategori hartanah [-berat hartanah] -panjang boolean [-model senarai]
[-gamma senarai] -gammacoefficient terapung -ngammacat integer -invarcoefficient terapung
-ninvarcat integer -invarfrac terapung -nhmmcategories integer -hmmrates pelbagai
-hmmkebarangkalian pelbagai -tapak adjsite boolean -lambda terapung -jumble integer
-benih integer -global boolean [-outgrno integer] -fail luar fail luar [-trout togol]
-outtreefile fail luar [-data cetakan boolean] [-kemajuan boolean] [-cap pokok boolean]
[-hypstate boolean]
fpromlk -membantu
DESCRIPTION
fpromlk ialah program baris arahan daripada EMBOSS (“The European Molecular Biology Open
Suite Perisian”). Ia adalah sebahagian daripada kumpulan arahan "Phylogeny:Molecular sequence".
PILIHAN
Input seksyen
-urutan seqsetall
Fail yang mengandungi satu atau lebih penjajaran jujukan
-intreefile pokok
-kategori integer
Nilai lalai: 1
-kadar pelbagai
-kategori hartanah
-berat hartanah
Tambahan seksyen
-panjang boolean
Nilai lalai: N
-model senarai
Nilai lalai: Jones-Taylor-Thornton
-gamma senarai
Nilai lalai: n
-gammacoefficient terapung
Nilai lalai: 1
-ngammacat integer
Nilai lalai: 1
-invarcoefficient terapung
Nilai lalai: 1
-ninvarcat integer
Nilai lalai: 1
-invarfrac terapung
Nilai lalai: 0.0
-nhmmcategories integer
Nilai lalai: 1
-hmmrates pelbagai
Nilai lalai: 1.0
-hmmkebarangkalian pelbagai
Nilai lalai: 1.0
-tapak adjsite boolean
Nilai lalai: N
-lambda terapung
Nilai lalai: 1.0
-jumble integer
-benih integer
Nilai lalai: 1
-global boolean
Nilai lalai: N
-outgrno integer
Output seksyen
-fail luar fail luar
-trout togol
Nilai lalai: Y
-outtreefile fail luar
-data cetakan boolean
Nilai lalai: N
-kemajuan boolean
Nilai lalai: Y
-cap pokok boolean
Nilai lalai: Y
-hypstate boolean
Nilai lalai: N
Gunakan fpromlke dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net