gdcm2vtk - Dalam Talian di Awan

JADUAL:

NAMA

gdcm2vtk - Tukar fail yang disokong oleh VTK ke DICOM.

SINOPSIS

gdcm2vtk [pilihan] fail masuk fail keluar

DESCRIPTION

. gdcm2vtk mengambil sebagai input mana-mana fail yang disokong oleh VTK (termasuk fail DICOM) dan akan
jana sebagai output fail DICOM.

PARAMETER

nama fail input fail masuk (DICOM atau VTK disokong)

nama fail keluaran fail (DICOM atau VTK disokong)

PILIHAN

khusus pilihan
--force-rescale force rescale.
--force-spacing jarak daya.
--palette-color apabila disokong menjana fail PALETTE COLOR.
--argb apabila disokong menjana fail ARGB.
--compress apabila disokong menjana fail termampat.
--use-vtkdicom Gunakan vtkDICOMImageReader (bukan GDCM).
--modaliti set Modaliti.
--bawah-kiri set bawah kiri.
--shift set syif.
--skala set skala.
--compress set mampatan (MetaIO).
-T --study-uid Kajian UID.
-S --siri-uid Siri UID.
--root-uid Root UID.

mampatan pilihan
-J --jpeg Mampatkan imej dalam jpeg.
-K --j2k Mampatkan imej dalam j2k.
-L --jpegls Mampatkan imej dalam jpeg-ls.
-R --rle Mampatkan imej dalam rle (tak rugi sahaja).

umum pilihan
-h --bantuan
cetak teks bantuan ini dan keluar

-v --versi
maklumat versi cetakan dan keluar

-V --verbose
mod verbose (amaran+ralat).

-W --amaran
mod amaran, cetak maklumat amaran

-E --kesilapan
mod ralat, maklumat ralat cetak

-D --nyahpepijat
mod nyahpepijat, cetak maklumat nyahpepijat

persekitaran berubah-ubah
GDCM_ROOT_UID Root UID

DESCRIPTION

Tukar fail yang disokong oleh VTK kepada DICOM.

Penggunaan biasa ialah:

$ gdcm2vtk output fail input.dcm

Ia menggunakan mekanisme kilang dalaman VTK untuk mengenali fail (fungsi CanRead). Lihat
Fail yang disokong VTK di sini:

Apakah format fail imej yang boleh dibaca dan ditulis oleh VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#Format_fail_imej_apa_boleh_VTK_baca_dan_tulis.3F

Jika fail input anda mempunyai 4 komponen, comp ke-4 (alfa) akan dialih keluar daripada output
fail sebagai DICOM tidak menyokong komponen alfa lagi (lihat pilihan –argb).

Penjagaan khusus telah diambil untuk format fail berikut:

1. DICOM: Direction Cosines dan vtkMedicalImageInformation dihantar ke output
2. BMP: Fail boleh disimpan dengan Jadual Carian (lihat --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties dihantar ke output
4. MINC: Kosinus Arah dihantar ke output
5. TIFF: vtkTIFFReader kini dalam keadaan buruk dalam VTK (tingkah laku berbeza dalam VTK 5.2 dan git/master). Hanya gunakannya, jika anda tahu apa yang anda lakukan.

CONVERT MetaImage (mhd, mha)
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

Perintah ini akan menukar fail DICOM input: fail input kepada fail MetaImage .mha. Sama
pergi untuk fail .mhd.

CONVERT MHA/MHD
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

or

$ gdcm2vtk inputfile output.mhd

Perintah ini akan menukar fail DICOM input: fail input kepada MetaImageData .mha/.mhd
fail.

CONVERT VTI
$ gdcm2vtk input fail output.vti

Perintah ini akan menukar fail DICOM input: fail input kepada XML VTK ImageData .vti
fail.

CONVERT VTK
$ gdcm2vtk input fail output.vtk

Perintah ini akan menukar fail DICOM input: fail input kepada VTK Structured lama
Fail PointSets .vtk.

CONVERT DICOM

$ gdcm2vtk input.dcm output.dcm

vtkGDCCMImageReader akan digunakan untuk membaca dalam fail DICOM, bukan lalai
vtkDICOMImageReader. Lihat pilihan –use-vtkdicom untuk menggunakan vtkDICOMImageReader.

PERJALANAN PUTAR DICOM KEPADA MHD KEPADA DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 output.mhd output.dcm

Refsection di atas menunjukkan cara untuk menukar DICOM menggunakan Tafsiran Fotometrik
YBR_FULL (atau pun YBR_FULL_422 adalah lossy) ke dalam format fail lain: MetaImage (mhd). Sejak
format fail ini tidak mengendalikan ruang warna, kami perlu menetapkannya secara eksplisit menggunakan
pilihan baris arahan –imageformat. Pilihan baris arahan –modality diperlukan dalam ini
kes kerana keluarga Kelas Penyimpanan Imej Tangkapan Menengah lalai tidak membenarkan YBR
Tafsiran Fotometrik.

GDCM2VTK NOTA

NOTA PENTING: VTK dalaman berstruktur akan diisi daripada input DICOM, dan kemudian
lulus kepada penulis DICOM output. Sesetengah maklumat mungkin hilang semasa penukaran
DICOM kepada VTK kepada DICOM. Pilihan ini kebanyakannya digunakan untuk menguji
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter gabungan.

NOTA PENTING: Apabila menukar daripada format lossy seperti JPEG, maklumat tentang
kerugian adalah penting. Keluaran DICOM akan mengandungi Imej Lossy yang diperlukan
Atribut mampatan yang menunjukkan bahawa imej telah dimampatkan lossy di suatu tempat di sepanjang
saluran paip. Lihat juga gdcmimg (pengendalian JPEG yang lebih baik secara umum).

NOTA PENTING: Apabila menggunakan –use-vtkdicom fail DICOM output akan sentiasa ditulis sebagai
Storan Imej MR kerana maklumat ini tidak tersedia daripada pembaca itu sendiri. Ini membenarkan
menetapkan Orientasi Imej (Pesakit) dengan betul.

Gunakan gdcm2vtk dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net