Ini ialah arahan indigo-cano yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
indigo-cano - menghasilkan SMILES kanonik atau kod berlapis untuk molekul dalam format MOL atau SDF
SINOPSIS
nila-kano nama fail.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [parameter]
nila-kano - SMILES [parameter]
DESCRIPTION
nila-kano digunakan untuk menghasilkan SMILES kanonik atau kod berlapis untuk molekul dalam MOL atau
format SDF.
PILIHAN
nila-kano mengharapkan fail atau kod SMILES pada input standard, yang kemudiannya mungkin
diikuti oleh satu atau lebih daripada parameter berikut.
-senyum
Keluaran SMILES kanonik (lalai)
-berlapis
Keluarkan kod berlapis kanonik
-ID
Medan ID dengan nama yang diberikan dalam fail SDF
-tiada-arom
Jangan aromatik molekul
-tiada-tetrahedral
Abaikan pusat stereo tetrahedral
-tiada-cistrans
Abaikan maklumat bon cis-trans
CONTOH
nila-kano infile.sdf
nila-kano infile.sdf.gz -ID molregno > results.txt
nila-kano infile.smi -berlapis -tiada-cistrans
nila-kano - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
Gunakan indigo-cano dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
