med2ris - Dalam Talian di Awan

JADUAL:

NAMA

med2ris - menukar data bibliografi Medline/Pubmed kepada format RIS

SINOPSIS

med2ris [-e logdest] [-f daripada-pengekodan] [-h] [-i] [-l tahap log] [-L fail log] [-O fail]
[-O fail] [-q] [-t kepada pengekodan] [-T jenis] [-y jalan]

DESCRIPTION

med2ris menukar data rujukan Pubmed kepada data RIS. Penukar memahami kedua-dua
ditandakan format Pubmed (yang secara dangkal menyerupai RIS) dan format XML mengikut
yang PubMedArticle DTD[1]. Dalam kebanyakan kes med2ris dapat mengesan input secara automatik
jenis data.

PILIHAN

-e log-destinasi
log-destination boleh mempunyai nilai 0, 1, atau 2, atau rentetan yang setara stderr,
syslog, Atau fail, masing-masing. Nilai ini menentukan ke mana maklumat log pergi.
0 (sifar) bermakna mesej dihantar ke stderr. Mereka boleh didapati dengan serta-merta di
skrin tetapi mereka mungkin mengganggu output arahan. 1 akan menghantar output ke
kemudahan syslog. Perlu diingat bahawa syslog mesti dikonfigurasikan untuk menerima mesej log
daripada program pengguna, lihat syslog(8) halaman manual untuk maklumat lanjut. seperti Unix
sistem biasanya menyimpan mesej ini dalam /var/log/user.log. 2 akan menghantar mesej kepada
fail log tersuai yang boleh ditentukan dengan -L pilihan.

-f daripada-pengekodan
Pilih pengekodan aksara input. Pengekodan yang disokong bergantung pada platform dan
biasanya boleh didapati di iconv_open(3). Jika tiada pengekodan dinyatakan, ISO-8859-1 aka
Latin-1 diandaikan.

-h
Memaparkan skrin bantuan dan penggunaan, kemudian keluar.

-i
Keluarkan maklumat tambahan tentang teg yang tidak diketahui atau tidak digunakan. Terutamanya berguna untuk nyahpepijat
penukaran jika format input telah berubah.

-l peringkat log
Tentukan keutamaan sehingga acara yang dilog. Ini sama ada nombor antara 0
dan 7 atau satu daripada rentetan muncul, berjaga-jaga, kr, sesat, amaran, notis, maklumat, debug,
masing-masing (lihat juga definisi peringkat Log). -1 melumpuhkan pengelogan sepenuhnya. A rendah
tahap log seperti 0 bermakna hanya mesej yang paling kritikal dilog. Log yang lebih tinggi
tahap bermakna peristiwa yang kurang kritikal dicatatkan juga. 7 akan termasuk nyahpepijat
mesej. Yang terakhir ini boleh menjadi verbose dan banyak, jadi anda ingin mengelakkan tahap log ini
melainkan anda perlu menjejaki masalah.

-L fail log
Tentukan laluan penuh ke fail log yang akan menerima mesej log. Biasanya ini
ialah /var/log/refdba.

-o fail
Hantar output ke fail. Jika fail wujud, kandungannya akan ditimpa.

-O fail
Hantar output ke fail. Jika fail wujud, output akan dilampirkan.

-q
Mulakan tanpa membaca fail konfigurasi. Pelanggan akan menggunakan masa penyusunan
lalai untuk semua nilai yang anda tidak tetapkan dengan suis baris arahan.

-t kepada pengekodan
Pilih pengekodan aksara output. Pengekodan yang disokong bergantung pada platform dan
biasanya boleh didapati di iconv_open(3). Jika tiada pengekodan dinyatakan, ISO-8859-1 aka
Latin-1 diandaikan.

-T jenis
Mengatasi pengesanan jenis automatik. Nilai yang dibenarkan untuk jenis ialah "tag" dan "xml"
untuk format Pubmed yang ditag dan format XML Pubmed, masing-masing.

-y confdir
Tentukan direktori di mana fail konfigurasi global berada Nota: Secara lalai, semua
Aplikasi RefDB mencari fail konfigurasi mereka dalam direktori yang ditentukan
semasa langkah konfigurasi semasa membina pakej. Iaitu, anda tidak memerlukannya -y
pilihan melainkan anda menggunakan binari tersusun di lokasi luar biasa, cth dengan menempatkan semula a
pakej rpm.

CONFIGURATION

med2ris menilai fail med2risrc untuk memulakan sendiri.

Jadual 1. med2risrc
┌──────────┬──────────────────────┬─────────────── ───────────┐
│Pembolehubah │ Lalai │ komen │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│outfile │ (tiada) │ Fail output lalai │
│ │ │ nama. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│tambah │ t │ Tentukan sama ada │
│ │ │ output dilampirkan (t) │
│ │ │ ke fail sedia ada atau │
│ │ │ menimpa (f) sebuah │
│ │ │ fail sedia ada. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│tidak dipetakan │ t │ Jika ditetapkan kepada t, tidak diketahui │
│ │ │ teg dalam data input │
│ │ │ akan dikeluarkan selepas │
│ │ │ a tag; yang │
│ │ │ data yang terhasil boleh menjadi │
│ │ │ diperiksa dan kemudian │
│ │ │ dihantar melalui sed kepada │
│ │ │ tanggalkan ini │
│ │ │ baris tambahan. Jika ditetapkan │
│ │ │ kepada f, tag yang tidak diketahui akan │
│ │ │ diabaikan dengan anggun. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│from_enc │ ISO-8859-1 │ Pengekodan aksara │
│ │ │ daripada data input │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│to_enc │ ISO-8859-1 │ Pengekodan aksara │
│ │ │ daripada data output │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│logfile │ /var/log/med2ris.log │ Laluan penuh │
│ │ │ fail log tersuai. Ini ialah │
│ │ │ digunakan hanya jika logdest ialah │
│ │ │ tetapkan dengan sewajarnya. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│logdest │ 1 │ Destinasi │
│ │ │ maklumat log. 0 = │
│ │ │ cetak ke stderr; 1 = guna │
│ │ │ kemudahan syslog; 2 = │
│ │ │ gunakan fail log tersuai. │
│ │ │ Yang terakhir memerlukan │
│ │ │ tetapan yang betul bagi │
│ │ │ fail log. │
├──────────┼──────────────────────┼─────────────── ───────────┤
│loglevel │ 6 │ Tahap log sehingga │
│ │ │ yang mana mesej akan menjadi │
│ │ │ dihantar. Tetapan rendah (0) │
│ │ │ membenarkan hanya yang paling │
│ │ │ mesej penting, a │
│ │ │ tetapan tinggi (7) membenarkan │
│ │ │ semua mesej termasuk │
│ │ │ mesej nyahpepijat. -1 bermaksud │
│ │ │ tiada apa yang akan dilog. │
└──────────┴──────────────────────┴─────────────── ───────────┘

DATA PEMPROSESAN

Kata kunci dengan berbilang subtajuk MeSH dibahagikan kepada berbilang kata kunci dengan satu MeSH
subtajuk setiap satu. Ini memudahkan pencarian subtajuk MeSH dengan sangat baik.

med2ris tidak mengesahkan fail input. Iaitu, fail input mesti melekat pada
peraturan sumber data, jika tidak, hasil penukaran tidak dapat diramalkan.

Gunakan med2ris dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net