mipe2dbSTS - Dalam Talian di Awan

JADUAL:

NAMA

mipe2dbSTS.pl - Menghasilkan fail input untuk diserahkan kepada dbSTS
disertakan dalam output: bahagian STS penyerahan dbSTS
berdasarkan MIPE versi v1.1
hujah: * mipe_file
* fail konfigurasi
* (pilihan) senarai ID PCR

Fail konfigurasi terdiri daripada baris yang mengandungi kunci dan nilai, dipisahkan oleh tanda yang sama ('=').
Kuncinya terdiri daripada nama huruf kecil bagi fail penyerahan NCBI (lihat tapak web dbSTS), diikuti dengan
garis bawah dan nama huruf kecil medan dalam fail itu.
Medan berikut harus ditakrifkan dalam fail konfigurasi:
pub_title=
pub_authors=
nama_sumber=
sumber_organisma=
cont_name=
samb_faks=
cont_tel=
cont_email=
samb_lab=
cont_inst=
samb_addr=
nama_protokol=
protokol_protokol=
nama_penampan=
penimbal_penampan=
sts_pcr_profile=
Untuk protocol_protocol, buffer_buffer dan sts_pcr_profile, lebih banyak baris diperlukan (lihat contoh).

Contoh fail konfigurasi kelihatan seperti ini:
pub_title=Pemetaan genetik SNP ayam
pub_authors=Aerts,JA; Veenendaal,T.; Crooijmans,RPMA; Groenen, MAM
source_name=DNA genomik ayam
source_organism=Gallus gallus
cont_name=Jan Aerts
cont_fax=+31 317 483929
cont_tel=+31 317 483397
cont_email=[e-mel dilindungi]
cont_lab=Pembiakan Haiwan dan Kumpulan Genomik
cont_inst=Universiti Wageningen
samb_addr=Peti Surat 338, 6700 AH Wageningen, Belanda
protocol_name=Protocol_Aerts
protocol_protocol=Templat: 30-60 ng
protocol_protocol=Primer: setiap 4 uM
protocol_protocol=dNTPs: setiap 200 uM
protocol_protocol=Taq: 0.3 unit
protocol_protocol=Volume: 12 ul
buffer_name=Buffer_Aerts
penimbal_penampan=MgCl2: 1.5 mM
penimbal_penampan=(NH4)2SO4: 20 mM
buffer_buffer=Tris-HCl: 75 mM
buffer_buffer=Antara 20: 0.01% (w/v)
penimbal_penampan=pH: 8.8

Gunakan mipe2dbSTS dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net