Ini ialah command tree_recon yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
tree_recon - Pembinaan semula pokok
SINOPSIS
tree_recon [PILIHAN] -m DALAM.DIST
DESCRIPTION
Bina semula pokok filogenetik daripada matriks Phylip IN.DIST.
-h, - membantu
Memaparkan mesej bantuan ini.
--versi
Paparkan maklumat versi
Input / Output:
-m, --matriks FAIL
Namakan fail matriks jarak Phylip. Mesti mengandungi sekurang-kurangnya tiga spesies. sah
jenis fail ialah: dist.
-o, --fail keluar FAIL
Laluan untuk menulis output ke. Jenis fail yang sah ialah: dot dan newick. Lalai: pokok.titik.
Pilihan Algoritma:
-b, --bina KAEDAH
Kaedah pembinaan pokok. nj: jiran-menyertai, min: UPGMA pautan tunggal, maks: UPGMA
pautan lengkap, purata: pautan purata UPGMA, wavg: pautan purata wajaran UPGMA.
Bergabung dengan jiran menghasilkan pokok yang tidak berakar. Kami akar pokok itu sekurang-kurangnya bercantum
sepasang. Satu daripada nj, min, maks, purata dan wavg. Lalai: nj.
HUBUNGI DAN RUJUKAN
Untuk pertanyaan atau komen, hubungi:
Tobias Rausch[e-mel dilindungi]>
Laman Utama SeqAn:
http://www.seqan.de
VERSION
versi tree_recon: 1.02 Kemas kini terakhir pada 17 Julai 2012
Gunakan tree_recon dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
