Ini ialah apl Linux bernama iCAS - Sistem Perhimpunan Klon Illumina untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai icas_v062.tar.bz2. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama iCAS ini - Sistem Perhimpunan Klon Illumina untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
iCAS - Sistem Perhimpunan Klon Illumina untuk dijalankan di Linux dalam talian
Ad
DESCRIPTION
Penjujukan klon demi klon, sebagai satu cara untuk mencapai pemasangan berkualiti tinggi untuk genom yang besar dan kompleks, terus mempunyai kaitan yang besar dalam era penjujukan pemprosesan tinggi. Walau bagaimanapun, pemasangan yang diperoleh menggunakan pemasang genom keseluruhan semasa sering berpecah-belah dan kadangkala mempunyai isu kesempurnaan genom disebabkan ciri data berbeza yang diperkenalkan oleh penjujukan berganda.Dengan iCAS, proses penapisan data adalah berdasarkan algoritma frekuensi kmer baru, menghasilkan bacaan prapemasangan yang hampir sempurna. Contigs dijana menggunakan algoritma pemasangan yang berbeza dan kemudian digabungkan bersama untuk mencapai kesinambungan yang lebih lama. Menjajarkan semula semua bacaan kembali ke draf contigs dan menentukur semula setiap asas jujukan mencapai konsensus akhir. Menggunakan klon siap untuk QC, saluran paip ini dapat memperoleh pemasangan dengan liputan klon 99.7% dan kualiti asas konsensus Q39.
Dibangunkan di Institut Wellcome Trust Sanger.
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
Perl, C
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/icas/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.