Ini ialah apl Linux bernama kallisto yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai kallisto_windows-v0.50.0.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi bernama kallisto ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
kallisto
DESCRIPTION
kallisto ialah program untuk kuantiti hampir optimum bagi kelimpahan transkrip daripada data RNA-Seq, atau lebih umum bagi jujukan sasaran menggunakan bacaan jujukan throughput tinggi. Ia berdasarkan idea menggunakan penjajaran semu untuk menentukan bacaan dan keserasian sasaran dengan cepat, tanpa memerlukan penjajaran.
Menurut penanda aras yang dilakukan pada komputer meja Mac, kallisto boleh mengukur 30 juta bacaan RNA-seq pukal manusia dalam masa kurang daripada 3 minit dengan hanya urutan bacaan dan indeks transkrip, yang dengan sendirinya boleh mengambil masa lebih daripada 10 minit untuk dibina. Dan oleh kerana ia menggunakan penjajaran semu, ia kukuh kepada ralat dalam bacaan dan mengekalkan maklumat penting yang diperlukan untuk pengkuantifikasian. Ini menjadikan kallisto bukan sahaja pantas tetapi juga sangat tepat. Dalam banyak penanda aras, ia juga mengatasi prestasi alat sedia ada.
Ciri-ciri
- Menggunakan pseudoalignment
- Cepat dan tepat
- RNA-Seq pukal yang dikira boleh dianalisis dengan sleuth
- Boleh digunakan dengan bustools untuk pra-memproses data RNA-seq sel tunggal
Bahasa Pengaturcaraan
C
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
