Ini ialah aplikasi Linux bernama MANTI.pl / muda.pl untuk dijalankan dalam Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai muda.pl-v3.6.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama MANTI.pl / muda.pl ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
MANTI.pl / muda.pl untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
-------- PERHATIAN MULA: PENAMAKAN SEMULAmuda.pl telah dinamakan semula kepada MANTI.pl dengan v3.7, pembangunan projek boleh dijejaki pada halaman projek MANTI pada sourceforge.net. Versi lama kekal di sini untuk tujuan arkib.
-------- PERHATIAN TAMAT
muda.pl ialah skrip penilaian (ditulis dalam Perl) tanpa pergantungan yang besar.
Ia mengumpulkan maklumat daripada 4 fail keluaran MaxQuant berbeza ke dalam fail induk yang sesuai secara eksplisit untuk analisis neo-termini protein. Sauh pusat untuk jemaah data ialah fail modificationSpecificPeptides.txt - data tambahan disimpulkan daripada fail sumber lain yang berbeza daripada folder txt MaxQuant tetapi titik permulaan untuk pemasangan data hanyalah fail modificationSpecificPeptides.txt. Mungkin juga berguna untuk tujuan proteomik biasa tetapi skrip ini sangat dioptimumkan untuk pengenalpastian dan pengesahan neo-termini protein.
Untuk penjelasan yang lebih teliti tentang parameter skrip dan strategi penilaian, sila rujuk PDF manual yang luas.
Ciri-ciri
- Penilaian data MaxQuant
- Pengenalan & pengesahan Protein-Termini
- Anotasi & pemasangan data UniProt
- Pemetaan semula Termini yang dikenal pasti kepada Isoform
- Penyepaduan Limma, LOCALIZER & TopFINDer
- didokumenkan
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
Perl
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/muda/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
