Ini ialah apl Linux bernama miRDP2 untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai miRDP2-v1.1.4.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama miRDP2 ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
miRDP2 untuk dijalankan di Linux dalam talian
Ad
DESCRIPTION
miRDeep-P2 (miRDP2) dibangunkan untuk menganalisis transkriptom mikroRNA (miRNA) dengan tepat dan pantas dalam tumbuhan. Ia diterima pakai daripada miRDeep-P (miRDP) dengan strategi baharu dan algoritma yang dibaik pulih. Kami telah menguji miRDP2 untuk menganalisis transkrip miRNA dalam tumbuhan sedemikian dengan saiz genom yang meningkat secara beransur-ansur seperti Arabidopsis, beras, tomato, jagung dan gandum. Berbanding dengan miRDeep-P dan beberapa alat pengiraan lain, miRDP2 memproses data NGS dengan kelajuan yang lebih tinggi. Dengan memasukkan kriteria anotasi miRNA tumbuhan yang baru dikemas kini, ketepatan miRDP2 juga bertambah baik dengan ketara. Keputusan kami menunjukkan miRDP2 sebagai alat yang cepat dan tepat untuk menganalisis transkrip miRNA dalam tumbuhan.rujukan: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
Ciri-ciri
- RNA kecil
- mikroRNA(miRNA)
- Penjujukan Generasi Seterusnya (NGS)
- Perl
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
Perl
Persekitaran Pangkalan Data
Perl DBI/DBD
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/mirdp2/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
