Ini ialah apl Linux bernama SuRankCo untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai surankco_r5.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama SuRankCo ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SuRankCo untuk dijalankan di Linux dalam talian
Ad
DESCRIPTION
SuRankCo ialah perisian berasaskan pembelajaran mesin untuk menjaringkan dan menyusun kedudukan contigs daripada himpunan de novo data penjujukan generasi akan datang. Ia melatih dengan penjajaran contigs dengan genom rujukan yang diketahui dan meramalkan skor dan kedudukan untuk contigs yang belum mempunyai genom rujukan yang berkaitan.Untuk butiran lanjut tentang SuRankCo dan fungsinya, sila lihat
"SuRankCo: Kedudukan Terkawal Contigs dalam Perhimpunan de novo"
Mathias Kuhring, Piotr Wojtek Dabrowski, Andreas Nitsche dan Bernhard Y. Renard
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
SILA AMBIL PERHATIAN, adalah disyorkan untuk membaca kertas dan fail readme.txt sebelum menggunakan SuRankCo.
Kemas kini Jun2015:
* Perubahan kecil untuk membolehkan sokongan BAM.
Kemas kini Feb2014:
* Menambah sokongan untuk pemasangan FASTA/SAM sebagai tambahan kepada ACE/FASTQ(QUAL).
NOTA: ciri pemasangan FASTA/SAM belum termasuk BaseCount, BaseSeqmentCount dan ContigQualities.
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
Jawa, S/R
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/surankco/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
