Ini ialah apl Windows bernama kSNP yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai kSNP4.1-source-code.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama kSNP ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan mana-mana emulator dalam talian OS OnWorks daripada tapak web ini, tetapi emulator dalam talian Windows yang lebih baik.
- 5. Daripada OS Windows OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi dan pasangnya.
- 7. Muat turun Wine dari repositori perisian pengedaran Linux anda. Setelah dipasang, anda kemudian boleh mengklik dua kali aplikasi untuk menjalankannya dengan Wine. Anda juga boleh mencuba PlayOnLinux, antara muka mewah melalui Wine yang akan membantu anda memasang program dan permainan Windows yang popular.
Wain ialah cara untuk menjalankan perisian Windows pada Linux, tetapi tanpa Windows diperlukan. Wain ialah lapisan keserasian Windows sumber terbuka yang boleh menjalankan program Windows secara langsung pada mana-mana desktop Linux. Pada asasnya, Wine cuba untuk melaksanakan semula Windows yang mencukupi dari awal supaya ia boleh menjalankan semua aplikasi Windows tersebut tanpa memerlukan Windows.
kSNP
Ad
DESCRIPTION
kSNP4 mengenal pasti SNP pan-genom dalam satu set jujukan genom, dan menganggarkan pokok filogenetik berdasarkan SNP tersebut. Penemuan SNP adalah berdasarkan analisis k-mer, dan tidak memerlukan penjajaran jujukan berbilang atau pemilihan genom rujukan, jadi kSNP4 boleh mengambil 100 genom mikrob sebagai input. Lokus SNP ditakrifkan oleh oligo panjang k mengelilingi alel SNP pusat. kSNP4 boleh menganalisis kedua-dua genom yang lengkap (selesai) dan genom yang belum selesai dalam contigs yang dipasang atau bacaan mentah yang belum dipasang. Genom siap dan belum selesai boleh dianalisis bersama, dan kSNP boleh memuat turun fail Genbank genom siap secara automatik dan memasukkan maklumat dalam fail tersebut ke dalam anotasi SNP.
Tiada kemahiran pengaturcaraan diperlukan untuk menggunakan kSNP4
Gardner, SN dan Hall, BG 2013. . PLoS ONE, 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
Gardner, SN, T. Slezak, dan BG Hall. 2015 Bioinformatik 31: 2877-2878 doi: 10.1093/bioinformatik/btv271
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/ksnp/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
