Dit is de opdracht altree-add-Sp die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
altree-add-S - Titel...
KORTE INHOUD
altree-add-S [opties]
Opties:
--versie programmaversie
--short-help|h kort helpbericht
--help helpbericht met beschrijvingen van opties
--man volledige documentatie
--eerste-invoerbestand|i invoerbestand 1
--second-input-file|j input file 2 gegevens betreffende de eigenschap (kwalitatief of kwantitatief)
--output-bestand|o uitvoerbestand
--epsilon|e epsilon-waarde
--data-type|t datatype: SNP of DNA
--proportion|p proportie gevallen in de steekproef (alleen voor kwalitatieve gegevens)
--data-qual|q gegevenstype: kwalitatief of kwantitatief
[--outgroup|g] naam van de outgroup
--low|l als een haplotype gelijk is aan of kleiner is dan -l keer, wordt de toestand van S ingesteld op "?"
OPTIES
--versie
Druk de programmaversie af en sluit af.
--korte-help
Druk een kort helpbericht af en sluit af.
--help Druk een helpbericht af met beschrijvingen van opties en uitgangen.
--Mens Drukt de handleiding af en sluit af.
--eerste-invoerbestand|i
Invoerbestand 1 (paup- of phylip-bestand)
--tweede-invoerbestand|j
Invoerbestand 2, bevat het aantal keren dat een bepaald haplotype per geval wordt gedragen
en controle-individuen (kwalitatieve gegevens) of de kwantitatieve waarden
corresponderend met een gegeven haplotype (kwantitatieve gegevens)
--output-bestand|o
Uitvoerbestand
--epsilon|e
espilon parameter (zie formule in de documentatie)
--gegevenstype|t
Type gegevens: DNA (ATGCU) of SNP (0-1)
--aandeel|p
Aandeel van case-individuen in de steekproef
--buitengroep|g
Naam van de outgroup (als deze niet in het bestand staat met het aantal gevallen en
controles per haplotype)
--data-kwaliteit|q
Geef aan of de gegevens kwalitatief of kwantitatief zijn
--laag|l als een haplotype gelijk is aan of kleiner is dan -l keer, wordt de toestand van S ingesteld
tot "?"
PRODUCTBESCHRIJVING
Deze programma voegt een nieuw teken toe (genaamd "karakter S") aan elk haplotype in de invoer
dossier op basis van het aantal gevallen en controles die het dragen.
Gebruik altree-add-Sp online met onworks.net-services
