altree-convertp - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

altree-convert - Titel...

KORTE INHOUD

altree-convert [opties]

Opties:
--versie programmaversie
--short-help|h kort helpbericht
--help helpbericht met beschrijvingen van opties
--man volledige documentatie
--eerste-invoerbestand|i invoerbestand 1
--second-input-file|j invoerbestand 2 (niet verplicht)
--output-bestand|o uitvoerbestand
--case-control-output|c uitvoer met de nb cases/controls
--gegevenstype|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--reconstruct-prog|r FASE|FAMHAP
--data-quali|q Type gegevens: kwalitatief of kwantitatief
--nbind-threshold|s Minimum aantal individuen dat nodig is om een ​​haplotype te behouden

OPTIES

--versie
Druk de programmaversie af en sluit af.

--korte-help
Druk een kort helpbericht af en sluit af.

--help Druk een helpbericht af met beschrijvingen van opties en uitgangen.

--Mens Drukt de handleiding af en sluit af.

--eerste-invoerbestand|i
Invoerbestand 1 (uitvoer van het haplotype-reconstructieprogramma)

--tweede-invoerbestand|j
Invoerbestand 2 (tweede uitvoer van famhap of bestand met de ziektestatus)

--output-bestand|o
Uitvoerbestand

--case-control-uitvoer|c
Uitvoerbestand met het aantal gevallen en controles die elk haplotype dragen

--gegevenstype|t "DNA"|"SNP"
Type gegevens: DNA (ATGCU) of SNP (0-1)

--phylo-prog|p "phylip"|"paup"
Fylogenie-reconstructieprogramma

reconstrueren-prog|r "famhap | fase"
Haplotype-reconstructieprogramma

data-kwalificatie|q "kwalitatief | kwantitatief"
Type gegevens geanalyseerd

nbind-drempel|s
Minimaal aantal individuen die een haplotype dragen dat nodig is om het te behouden
verdere analyse. Als je alle haplotypes wilt behouden, moet je hier 0 op beïnvloeden
variabele

PRODUCTBESCHRIJVING

In deze programma zal de opgegeven invoerbestanden lezen en een invoerbestand genereren voor de
fylogenetische reconstructiesoftware paup of phylip/paml

Gebruik altree-convertp online met behulp van onworks.net-services