Dit is de opdracht asn2ff die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
asn2ff - converteer ASN.1 biologische gegevens naar een plat formaat (oude versie)
KORTE INHOUD
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a bestandsnaam] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l bestandsnaam] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o bestandsnaam] [-p F] [-q] [-r bestandsnaam] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
PRODUCTBESCHRIJVING
asn2ff converteert beschrijvingen van biologische sequenties van NCBI's ASN.1-formaat naar een van
verschillende platte bestandsformaten. Dit programma is gebouwd rond een verouderde interface; Alsjeblieft
. asn2gb(1) gebruiken.
OPTIES
Hieronder vindt u een overzicht van de mogelijkheden.
- Gebruiksbericht afdrukken
-A X Toon regio vanaf X (standaard is 0)
-B X Toon regio die eindigt op X (standaard is laatste positie)
-C Bankit-opmerkingen tonen
-G De output is slechts één topbioseq in genoomweergave
-L F Gebruik het oude (vóór Genbank 127.0) LOCUS-lijnformaat
-M De uitvoer bestaat alleen uit kaartbioseqs
-R Voor GenBank-release
-V F Gebruik VERSIE niet
-a bestandsnaam
Bestandsnaam voor ASN.1-invoer (standaard is stdin)
-b Voer asnfile in binaire modus in
-d Gebruik SeqMgr-indexering
-e Invoer is een Seq-invoer
-f b/p/e/s/x/z
Output Format:
b GenBank (standaard)
p GenPept
de EMBL
s Pseudo-EMBL
x GenBankSelect
z EMBLPEPT
-g Gi-nummers weergeven
-h F Volgorde verbergen
-k F Gebruik geen complexe sets (phy-set,mut-set, pop-set)
-l bestandsnaam
Log fouten naar bestandsnaam
-m r/d/s/c/k/l/e/p
Uitvoermodus:
r-release (standaard)
d dumpen
s Pailletten
c Chromoscoop
k dir-sub-debug
Ik dir-sub
e herzien
p gedeeltelijk rapport
-n F Strikte genbinding
-o bestandsnaam
Uitvoerbestandsnaam (standaard is stdout)
-p F Laat nieuwe genkenmerken weg
-q De uitvoer is slechts één topbioseq
-r bestandsnaam
Uitvoerfoutlogbestand (standaard is stderr)
-s De invoer is een Seq-submit
-t Toon uitgebreide berichttekst
-v F Onderdruk foutmeldingen
-w Gebruik het HTML-uitvoerformaat
-y Alleen afdrukhulpformaat
-z Nieuw algoritme voor ornamenten
Gebruik asn2ff online met behulp van onworks.net-services
