Dit is de opdracht bowtie2-inspect die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
bowtie2-inspect - wikkel voor bowtie2-inspect-* index
KORTE INHOUD
bowtie2-inspecteren [opties]*
PRODUCTBESCHRIJVING
Bowtie 2 versie 2.2.6 door Ben Langmead ([e-mail beveiligd], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 bestandsnaam minus .1.bt2/.2.bt2
Standaard worden FASTA-records van de geïndexeerde nucleotidesequenties afgedrukt naar standaard
uit. Met -n, drukt alleen namen af. Met -s, drukt alleen een samenvatting van de index af
parameters en sequenties. Met -e, behoudt kleuren indien van toepassing.
OPTIES
--grote index
dwing inspectie van de 'grote' index af, zelfs als er een 'kleine' index aanwezig is.
-a/--over
Aantal tekens in FASTA-uitvoer (standaard: 60)
-n/--namen
Druk alleen referentiereeksnamen af
-s/--samenvatting
Samenvatting afdrukken incl. ref-namen, lengtes, indexeigenschappen
-e/--bt2-ref
Reconstrueer referentie uit .bt2 (langzaam, behoudt kleuren)
-v/--uitgebreid
Uitgebreide uitvoer (voor foutopsporing)
-h/--helpen
druk een gedetailleerde beschrijving van het gereedschap en zijn opties af
--help print dit gebruiksbericht
Gebruik bowtie2-inspect online met behulp van onworks.net-services
