Dit is de opdracht bp_multi_hmmsearch.plp die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
multi_hmmsearch - voer een hmmsearch uit in meerdere FASTA-bestanden met behulp van
een INDEX-bestand
KORTE INHOUD
multi_hmmsearch -p hmm_bestand [-i] -f indexbestand
PRODUCTBESCHRIJVING
Technisch gezien geen Bio::Tools::Run-script, omdat dit geen Bioperl- of Bioperl-run gebruikt
componenten, maar het is nuttig.
Verplicht Opties:
-p HMM-profiel dat voor de zoekopdracht moet worden gebruikt.
-f INDEX-bestand dat een lijst met FASTA-bestanden voor het meerdere bevat
zoeken.
special Opties:
-i Maak een nieuw indexbestand met de resulterende hmms-bestanden. Dit is
handig als u deze lijst als invoerargumenten wilt doorgeven
een ander programma.
-h Toon deze documentatie.
FEEDBACK
Mailing lijsten
Gebruikersfeedback is een integraal onderdeel van de evolutie van deze en andere Bioperl-modules. Versturen
uw opmerkingen en suggesties bij voorkeur naar de Bioperl mailinglijst. Uw deelname
wordt zeer op prijs gesteld.
[e-mail beveiligd] - Algemene discussie
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Over de mailinglijsten
Rapportage bugs
Rapporteer bugs aan het Bioperl-bugvolgsysteem om ons te helpen de bugs en hun
oplossing. Bugrapporten kunnen via het web worden ingediend:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Gebruik bp_multi_hmmsearch.plp online met behulp van onworks.net-services