cmtk-asegment_sri24 - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

asegment_sri24 - Segmentatie met SRI24-atlas

KORTE INHOUD

asegment_sri24 DoelAfbeeldingUitvoerAfbeelding

PRODUCTBESCHRIJVING

Registreer vervolgens een doelbeeld op een geselecteerd kanaal van de SRI24 menselijke hersenatlas
herformatteer een van de atlaslabeltoewijzingen naar de doelafbeelding. Opmerking: er wordt aangenomen dat de
het doelbeeld is ontdaan van de schedel, dwz bevat alleen de hersenen.

OPTIES

Globaal Toolkit Opties (deze zijn gedeeld by allen CMTK hulpmiddelen)
--help
Schrijf een lijst met basisopdrachtregelopties naar standaarduitvoer.

--Help iedereen
Schrijf een volledige lijst met basis- en geavanceerde opdrachtregelopties naar standaarduitvoer.

--wiki
Schrijf een lijst met opdrachtregelopties naar standaarduitvoer in MediaWiki-opmaak.

--Mens
Schrijf de man-paginabron in 'nroff'-opmaak naar standaarduitvoer.

--xml
Schrijf de syntaxisspecificatie van de opdrachtregel in XML-opmaak (voor Slicer-integratie).

--versie
Schrijf toolkitversie naar standaarduitvoer.

--echo
Schrijf de huidige opdrachtregel naar de standaarduitvoer.

--uitgebreid-niveau
Stel breedsprakigheidsniveau in.

--uitgebreid, -v
Verhoog het breedsprakigheidsniveau met 1 (verouderd; ondersteund voor achterwaartse compatibiliteit).

--draden
Stel het maximum aantal parallelle threads in (voor POSIX-threads en OpenMP).

Hoofd Opties
--snel, -f
Snelle modus.

--registratiekanaal
Het SRI24-kanaal dat wordt gebruikt voor registratie op het doelbeeld. Ondersteunde waarden:
"spgr", "early-fse", "late-fse", "fa", waarbij de standaard "spgr" is, of gebruik een van de
volgende:

--spgr
SPGR (T1-gewogen) structureel kanaal [Dit is de standaard]

--vroege-fse
Early-echo (PD-gewogen) snel spin-echokanaal

--laat-fse
Late-echo (T2-gewogen) snel spin-echokanaal

--fa Fractionele anisotropiekanaal, afgeleid van diffusie tensorbeelden

--label-kaart
De SRI24-labeltoewijzing die opnieuw is geformatteerd naar de doelafbeelding. Ondersteunde waarden:
"tzo116plus", "lpba40", "tissue", waarbij de standaardwaarde "tzo116plus" is, of gebruik een van
het volgende:

--tzo116plus
Uitgebreide corticale verkavelingssjabloon op basis van de Tzourio-Mazoyer AAL 116-regio
sjabloon. [Dit is de standaard]

--lpba40
Sjabloon gebaseerd op de 40 subject LONI Probabilistic Brain Atlas-segmentatie.

--zakdoek
SRI24 maximale waarschijnlijkheid drie compartimenten (GM, WM, CSF) weefselsegmentatie
kaart.

AUTEURS

Torsten Rohlfing, met bijdragen van Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff en Yaroslav Halchenko

Gebruik cmtk-asegment_sri24 online met behulp van onworks.net-services