Dit is het commando dbSwiss dat kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
dbSwiss - maak een DBM-versie van Swiss-Prot-gegevens
KORTE INHOUD
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss [OPTIES]
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss --datadir /data/swissprot --infile
/data/swissprot/uniprot_sprot.dat
/usr/share/librg-utils-perl/dbSwiss [--help] [--man]
PRODUCTBESCHRIJVING
dbSwiss maakt een DBM-versie van Swiss-Prot-gegevens. Deze procedure is ter vervanging
splitSwiss.pl. splitSwiss.pl slaat Swiss-Prot-records op in afzonderlijke bestanden, wat resulteert in meer dan
13 miljoen relatief kleine bestanden die erg lang duren om te maken en te rsync. in plaats daarvan dbSwiss
slaat elk record op in een DBM-database die is geoptimaliseerd voor snel ophalen.
OPTIES
-d, --datamap=pad
map met databasebestanden, standaard: '/mnt/project/rost_db/data/swissprot'
--debuggen
--nodebug
--eerste20
--geeneerste20
verwerk alleen de eerste 20 records, voor foutopsporing
--help
-i, --infile=pad
Swiss-Prot data flatfile, standaard:
'/mnt/project/rost_db/data/swissprot/uniprot_sprot.dat'.
--Mens
--stil
--rustig
druk de voortgangsstatus niet af
--teruglezen
--geen teruglezen
records na opslag teruglezen en afdrukken
--tafel
naam van databasetabel en bijgevolg de basisnaam van databasebestanden, standaard:
'dbswiss'
--versie
-w, --werkmap=pad
Optionele werkmap. Automatisch gemaakt en verwijderd indien niet gedefinieerd.
Gebruik dbSwiss online met behulp van onworks.net-services