Dit is de opdracht fastatool die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
sneltool - Biedt a reeks of tools nuttig wanneer werkzaam Met FAST bestanden.
PRODUCTBESCHRIJVING
Dit programma maakt deel uit van het MIRA-assemblerpakket. Fastatool biedt een set tools
handig bij het werken met FASTA-traceerbestanden.
Bekijk de onderstaande documentatie voor meer gedetailleerde informatie.
KORTE INHOUD"
sneltool <gereedschap parameters>
OPTIES
clip Clips baseert links en rechts van een FASTA-reeks, schrijft het resultaat naar STDOUT.
Gebruik:
clipFASTA -l linkerclip -r rechterclip fastainbestand
ontsmetten
Verwijdert sequenties met niet-IUPAC-basen of lege sequenties uit een FASTA-bestand, schrijft
de 'overlevende' sequenties naar een nieuw bestand. Als er een kwaliteitsbestand wordt opgegeven, wordt er een opgeschoond
versie daarvan is ook geschreven. De reeksen in de kwaliteitsbestanden (indien opgegeven)
MOET in dezelfde volgorde staan als in het fasta-bestand.
Gebruik:
sanitizeFASTA fastainfile fastaoutfile [fastaqualin fastaqualoutfile]
Gebruik fastatool online met behulp van onworks.net-services
