Dit is de opdracht fastq_quality_filter die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
fastq_quality_filter - Filtert sequenties op basis van kwaliteit
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Onderdeel van
FASTX Toolkit 0.0.14 door A. Gordon ([e-mail beveiligd])
[-h] = Dit handige helpscherm.
[-q N] = Minimale kwaliteitsscore om te behouden.
[-p N] = Minimum percentage basen dat [-q] kwaliteit moet hebben.
[-z] = Uitvoer comprimeren met GZIP.
[-i INFILE]
= FASTA/Q invoerbestand. standaard is STDIN.
[-o OUTFILE] = FASTA/Q-uitvoerbestand. standaard is STDOUT. [-v] = Uitgebreid -
rapport aantal reeksen.
Als [-o] is opgegeven,
rapport wordt afgedrukt naar STDOUT.
Als [-o] niet is opgegeven (en de uitvoer gaat naar STDOUT), wordt het rapport afgedrukt naar
STDERR.
Gebruik fastq_quality_filter online met behulp van onworks.net-services