Dit is de opdracht hmm2convert die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
hmm2convert - converteren tussen profiel-HMM-bestandsformaten
KORTE INHOUD
hmm2converteren [Opties] oudhmmbestand nieuwhmmbestand
PRODUCTBESCHRIJVING
hmm2converteren leest een HMM-bestand uit oudhmmbestand in elk HMMER-formaat, en schrijft het naar een nieuw
filet nieuwhmmbestand in een nieuw formaat. oudhmmbestand en nieuwhmmbestand moeten verschillende bestanden zijn; Jij
kan het oude bestand niet betrouwbaar overschrijven. Standaard wordt het nieuwe HMM-bestand geschreven in HMMER 2
ASCII-formaat.
Beschikbare formaten zijn HMMER 2 ASCII (standaard), HMMER 2 binair (-B) GCG-profiel (-P) en
Compugen XSW uitgebreid profiel (-P).
OPTIES
-a Converteren naar HMMER 2 ASCII-bestand. Dit is de standaardinstelling, dus deze optie is niet nodig.
-b Converteren naar HMMER 2 binair bestand.
-h Korte hulp afdrukken; inclusief versienummer en overzicht van alle opties, inclusief
deskundige opties.
-p Converteren naar GCG-profiel .prf-indeling.
-A Toevoegmodus; toevoegen aan nieuwhmmbestand in plaats van een nieuw bestand te maken.
-F Kracht; als nieuwhmmbestand bestaat al, en -A wordt niet gebruikt om toe te voegen aan de
bestand, zal hmm2convert weigeren het bestaande bestand te vernietigen, tenzij -F is gebruikt.
-P Converteer de HMM naar het uitgebreide Compugen XSW-profielformaat, vergelijkbaar met GCG
profielformaat, maar heeft twee extra kolommen voor de kosten voor verwijderen-openen en verwijderen-uitbreiden.
(Ik geloof niet dat Compugen dit formaat publiekelijk ondersteunt; dat kan wel zo zijn
ongedocumenteerd.)
Gebruik hmm2convert online met behulp van onworks.net-services
