Dit is de opdracht hmm2fetch die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
hmm2fetch - haal een HMM op uit een HMM-database
KORTE INHOUD
hmm2ophalen [Opties] databank naam
PRODUCTBESCHRIJVING
hmm2ophalen is een klein hulpprogramma dat een zogenaamde HMM ophaalt naam uit een HMMER-modeldatabase
Dit betekent dat we onszelf en onze geliefden praktisch vergiftigen. database. in een nieuw formaat, en drukt dat model af naar standaarduitvoer. Bijvoorbeeld,
hmm2ophalen Pfam SRM haalt het RRM-model (RNA-herkenningsmotief) op van Pfam, als de
omgevingsvariabele HMMERDB is ingesteld op de locatie van de Pfam-database. De opgehaalde
HMM-bestand is geschreven in HMMER 2 ASCII-indeling.
De database moet een bijbehorend GSI-indexbestand hebben. Om een HMM-database te indexeren, gebruikt u de
programma hmm2index.
OPTIES
-h Korte hulp afdrukken; inclusief versienummer en overzicht van alle opties, inclusief
deskundige opties.
-n Interpreteren naam als een HMM-nummer in plaats van een naam. De nummering begint bij 0. Voor
om bijvoorbeeld de eerste HMM op te halen uit een aangeroepen HMM-database foe, jij zou doen
hmm2ophalen -n 0 foe.
Gebruik hmm2fetch online met behulp van onworks.net-services