Dit is de opdracht hmmconvert die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
hmmconvert - converteer profielbestand naar een HMMER-formaat
KORTE INHOUD
hmmconverteren [Opties]
PRODUCTBESCHRIJVING
De hmmconverteren hulpprogramma converteert een invoerprofielbestand naar verschillende HMMER-indelingen.
Het invoerprofiel kan standaard in elk HMMER-formaat zijn, inclusief oude/verouderde formaten
van HMMER2, ASCII of binair; het uitvoerprofiel is een actueel HMMER3 ASCII-formaat.
kan '-' (streepje) zijn, wat betekent dat deze invoer wordt gelezen van stdin in plaats van een bestand.
OPTIES
-h Helpen; print een korte herinnering aan het gebruik van de opdrachtregel en alle beschikbare opties.
-a Uitvoerprofielen in ASCII-tekstformaat. Dit is de standaardinstelling.
-b Uitvoerprofielen in binair formaat.
-2 Uitvoer in legacy HMMER2 ASCII-tekstformaat, in ls (glocale) modus. Hierdoor kan HMMER3
modellen worden terug geconverteerd naar een nauwkeurige benadering van HMMER2, voor vergelijkende
studies.
--outfmt
Uitvoer in een ander HMMER3 ASCII-tekstformaat dan het meest recente. Geldig
keuzes voor zijn 3/a tot en met 3/v. Het huidige formaat is 3/f, en dit is de
standaard. Het formaat 3/b werd gebruikt in de officiële HMMER3-release, en de andere
werden gebruikt in de verschillende testversies.
Gebruik hmmconvert online met onworks.net-services
