Dit is de opdracht indigo-cano die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
indigo-cano - produceer canonieke SMILES of gelaagde code voor moleculen in MOL- of SDF-formaat
KORTE INHOUD
indigo-cano bestandsnaam.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [parameters]
indigo-cano - SMILES [parameters]
PRODUCTBESCHRIJVING
indigo-cano wordt gebruikt om canonieke SMILES of gelaagde code voor moleculen in MOL of
SDF-formaat.
OPTIES
indigo-cano verwacht een bestand of SMILES-code op de standaardinvoer, wat dan zou kunnen zijn
gevolgd door een of meer van de volgende parameters.
-glimlacht
Uitvoer canonieke SMILES (standaard)
-gelaagde
Voer canonieke gelaagde code uit
-ID kaart
ID-veld met de opgegeven naam in een SDF-bestand
-geen-aroma
Aromatiseer moleculen niet
-geen tetraëdrische
Negeer tetraëdrische stereocentra
-geen-cistrans
Negeer informatie over cis-transobligaties
Voorbeelden
indigo-cano inbestand.sdf
indigo-cano infile.sdf.gz -ID kaart molregno > resultaten.txt
indigo-cano infile.smi -gelaagde -geen-cistrans
indigo-cano - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
Gebruik indigo-cano online met behulp van onworks.net-services
