het EngelsFransSpaans

Servers draaien | Ubuntu > | Fedora > |


OnWorks-favicon

indigo-deco - Online in de cloud

Voer indigo-deco uit in OnWorks gratis hostingprovider via Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

Dit is de opdracht indigo-deco die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

PROGRAMMA:

NAAM


indigo-deco - molecuul scaffold detectie en R-groep deconvolutie

KORTE INHOUD


indigo-deco bestanden [parameters]

indigo-deco -h

PRODUCTBESCHRIJVING


indigo-deco voert molecuulsteigerdetectie en R-groepdeconvolutie uit. Geaccepteerd
formaten zijn: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES en CML.

OPTIES


indigo-deco accepteert de volgende parameters.

-h Help-bericht afdrukken

-a Bereken geschatte steiger (standaard is exact)

-s
Schrijf maximaal gevonden steiger naar molfile

-S
Schrijf alle gevonden steigers naar SD-bestand

-l
Geen steiger berekenen, maar laden uit bestand

-sr
Schrijf een scaffold met R-sites naar een bestand

-o
Schrijf resulterende gemarkeerde moleculen naar bestand

-r
Schrijf resulterende moleculen met gescheiden r-groepen naar een bestand

aangemaakt Geen aromatische overweging

-- Markeert het einde van opties

Voorbeelden


indigo-deco *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
Lees moleculen uit molfiles in de huidige directory, sla maximaal gevonden scaffold op
naar scaf.mol en de gemarkeerde moleculen opslaan in hl.sdf.

indigo-deco structuur.mol veel.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
Lees één molecuul uit structure.mol en meerdere moleculen uit many.sdf, opslaan
moleculen met r-rgoups naar rg.sdf en sla alle gevonden steigers op naar allscafs.sdf.

indigo-deco *.smi -d readyscaf.mol -o hl.sdf
Lees meerdere moleculen uit elk SMILES-bestand in de huidige map, lees
scaffold van readyscaf.mol en sla gemarkeerde moleculen op in hl.sdf.

Gebruik indigo-deco online met onworks.net-services


Ad


Ad