Dit is de opdracht maf2anchors.pl die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
maf2anchors - Converteert maf-bestanden naar Murasaki-ankersets
KORTE INHOUD
maf2ankers
OPTIES
--voorvoegsel=
gebruik als voorvoegsel voor uitvoerbestandsnamen (anders wordt )
--scheuren=
laat breuken toe.
--fakeseqs
valse sequentielengtebestanden en sequentiestubs genereren op basis van sequentielengtegegevens
in MAF-bestand
--vertrouwen
vertrouw op de commentaarannotatie die door TBA is toegevoegd op de tweede regel van het bestand (indien aanwezig)
dat het de boom vermeldt die bij de uitlijning wordt gebruikt en alle betrokken sequenties. Standaardwaarden
aan. gebruik --notrust om TBA-tags te wantrouwen (technisch gezien maken deze gegevens geen deel uit van de
bestandsformaatspecificatie en is gewoon gepropt in opmerkingen die TBA produceert, maar
is mogelijk niet aanwezig of nauwkeurig in alle MAF-bestanden, daarom geven wij u de optie
wantrouw het).
--soort
Sorteer de gevonden reeksen op --trust (zodat ze overeenkomen met de uitvoer die zou hebben
gebeurde met --notrust).
Gebruik maf2anchors.pl online met behulp van onworks.net-services
