Dit is de opdracht masai_output_pe die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
masai_output_pe - Masai-uitvoer - Gekoppelde eindmodus
KORTE INHOUD
masai_output_pe [OPTIES]
PRODUCTBESCHRIJVING
Masai is een snelle en nauwkeurige mapper voor lezen op basis van geschatte zaden en meerdere
teruglopen.
Bekijk http://www.seqan.de/projects/masai voor meer informatie.
(c) Copyright 2011-2012 door Enrico Siragusa.
-h, --help
Geeft dit helpbericht weer.
--versie
Weergave versie-informatie
Koppelingsopties:
-ng, --geen gaten
Lijn de uitlezingen niet uit met lacunes.
-NS, --bibliotheek-lengte NUM
Bibliotheek lengte. Standaard: 220.
Ze, --bibliotheek-fout NUM
Bibliotheek lengte tolerantie. Standaard: 50.
Uitgangsopties:
-t, --tmp-map STR
Geef een grote tijdelijke map op. Standaard: gebruik de genoommap.
-o, --uitvoerbestand FILE
Geef een uitvoerbestand op. Standaard: gebruik het voorvoegsel reads bestandsnaam. Geldige bestandstypen
zijn: rauw en sam.
-nc, --Geen sigaar
Voer geen SIGAR-reeks uit. Dit heeft alleen invloed op SAM-uitvoer.
Foutopsporingsopties:
-nd, --geen dump
Dump geen resultaten.
VERSIE
masai_output_pe versie: 0.7.1 [14053] Laatste update 2013-05-16
Gebruik masai_output_pe online met onworks.net-services