mia-2dmyocard-ica - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

mia-2dmyocard-ica - Voer een ICA-analyse uit op een reeks 2D-afbeeldingen

KORTE INHOUD

mia-2dmyocard-ica -i [Opties]

PRODUCTBESCHRIJVING

mia-2dmyocard-ica Dit programma wordt gebruikt om een ​​ICA uit te voeren op een reeks myocardperfusies
afbeeldingen om synthetische referenties te creëren die kunnen worden gebruikt voor bewegingscorrectie per afbeelding
registratie. Als het doel is om een ​​volledige bewegingscompensatie uit te voeren, is het beter om deze te creëren
een segmentatieset en gebruik mia-2dmyoica-nonrigid. Als de invoergegevens worden opgegeven door middel van a
segmentatieset, dan kan ook mia-2dmyocard-icaseries worden gebruikt. Dit programma is
wordt hoofdzakelijk gebruikt om verschillende opties te testen voor het uitvoeren van de ICA-referentieafbeelding
creatie.

OPTIES

-i --in-base=(invoer, vereist); io
voer de bestandsnaam van het volgende patroon in XXXX.ext X=nummers Voor ondersteund bestand
typen zie PLUGINS:2dimage/io

--coefs=
uitvoer mengcoëfficiënten naar dit bestand

-o --out-base=(uitvoer); snaar
uitvoerbestandsnaambasis

-t --type=exr
uitvoerbestandstype
ondersteunde waarden zijn:( @, BMP, DCM, EXR, Jpeg, JPG, PNG, RAUW,
TIF, TIF, V, UITZICHT, bmp, dcm, ex, jpeg-, jpg, png, rauw, tyfus,
Tiff, v, uitzicht, )

-k --overslaan=2
afbeeldingen aan het begin van een serie overslaan afbeeldingen aan het begin van een serie overslaan

-e --einde=60
laatste afbeelding in serielaatste afbeelding in serie

-C --componenten=0
nr. van componenten, 0=automatisch schattennr. van componenten, 0=schatting
webmaster.

-m --strip-gemiddelde
strip gemiddelde afbeelding uit serie

-f --opslaan-functies=
functieafbeelding opslaan

-p --strip-periodiek
alleen periodieke component strippen

-x --max-ica-iteraties=0
max. ICA-oplosser-iteratiesmax. ICA-oplosser-iteraties

-n --ica-normaliseren
ica_normalize feature-afbeeldingen

--alle-functies=
sla alle feature-afbeeldingen op

-L --LV-crop-amp=0
LV-bijsnijdmaskerversterking, 0.0 = niet bijsnijdenLV-bijsnijdmaskerversterking, 0.0
= niet bijsnijden

-a --auto-componenten
automatische schatting van het aantal componenten op basis van correlatie. Impliceert
-m en -n (experimenteel)

Help & Info
-V --verbose=waarschuwing
uitgebreide output, print berichten van een bepaald niveau en hogere prioriteiten.
Ondersteunde prioriteiten vanaf het laagste niveau zijn:
info ‐ Berichten op laag niveau
opsporen ‐ Functie-aanroep traceren
mislukken ‐ Rapporteer testfouten
waarschuwing ‐ Waarschuwingen
fout ‐ Meld fouten
debug ‐ Uitvoer debuggen
Bericht ‐ Normale berichten
fataal ‐ Rapporteer alleen fatale fouten

--auteursrechten
copyrightinformatie afdrukken

-h-help
print deze hulp

-? --gebruik
een korte help afdrukken

--versie
print het versienummer en sluit af

In behandeling
--draden=-1
Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking. Dit aantal moet lager zijn
of gelijk aan het aantal logische processorcores in de machine. (-1:
automatische schatting). Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking, This
getal moet lager zijn dan of gelijk zijn aan het aantal logische processorkernen in
de machine. (-1: automatische schatting).

PLUG-INS: 2dbeeld/io

bmp BMP 2D-beeld input/output ondersteuning

Erkende bestandsextensies: .BMP, .bmp

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

datapool Virtuele IO van en naar de interne datapool

Erkende bestandsextensies: .@

dicom 2D-beeld io voor DICOM

Herkende bestandsextensies: .DCM, .dcm

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit

EXR een 2dimage io-plug-in voor OpenEXR-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .EXR, .exr

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekende 32 bit, drijvende komma 32 bit

jpg een 2dimage io-plug-in voor jpeg-grijswaardenafbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekende 8 bit

png een 2dimage io-plug-in voor png-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .PNG, .png

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

rauw Ondersteuning voor RAW 2D-beelduitvoer

Herkende bestandsextensies: .RAW, .raw

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

tif TIFF 2D-beeld invoer/uitvoer ondersteuning

Herkende bestandsextensies: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit

vergezicht een 2dimage io-plug-in voor vista-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .V, .VISTA, .v, .vista

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

VOORBEELD

Evalueer de synthetische referenties van afbeeldingen imageXXXX.exr en sla ze op in refXXXX.exr
door vijf onafhankelijke componenten te gebruiken, bedoelen we het strippen, normaliseren en overslaan van twee afbeeldingen.

mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

AUTEUR(s)

Gert Wolny

COPYRIGHT

Op deze software rust copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Duitsland en Madrid, Spanje. Het komt
met ABSOLUUT GEEN GARANTIE en u mag het herdistribueren onder de voorwaarden van de GNU
ALGEMENE PUBLIEKE LICENTIE Versie 3 (of later). Voer voor meer informatie het programma uit met de
optie '--copyright'.

Gebruik mia-2dmyocard-ica online met behulp van onworks.net-services