Dit is de Linux-app met de naam FASTQSim die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als FASTQsim_v2.0.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam FASTQSim online uit om gratis online met OnWorks in Linux te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
FASTQSim om online onder Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
FASTQSim is een tool die de dubbele functionaliteit biedt van Next-Gen Sequencing datasetkarakterisering en metagenomische datageneratie.FASTQSim is platformonafhankelijk voor sequentiëring en berekent distributies van leeslengte, kwaliteitsscores, indel-percentages, single-point-mutatiesnelheden, indel-grootte en vergelijkbare statistieken voor elke sequentiëring
platform. Om trainings- of testdatasets te maken, heeft FASTQSim de mogelijkheid om doelreeksen om te zetten in in silico-uitlezingen met bijpassende
fout profielen.
Met FASTQsim kan de gebruiker individuele gelezen datasets simuleren die kunnen worden gebruikt als gestandaardiseerde testscenario's voor het plannen van sequencing-projecten of voor het benchmarken van metagenomische software. In dit opzicht hebben in silico-datasets die zijn gegenereerd met de FASTQsim-tool verschillende voordelen ten opzichte van natuurlijke datasets: ze zijn platformonafhankelijk, extreem goed gekarakteriseerd en minder duur om te genereren.
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/fastqsim/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
