Dit is de Linux-app genaamd GenOO-HTS om online in Linux te draaien, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam GenOO-HTS online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
GenOO-HTS om online onder Linux te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
GenOO-HTS [jee-noo] is een open-source; objectgeoriënteerd Perl-framework speciaal ontwikkeld voor het ontwerpen van High Throughput Sequencing (HTS) analysetools. Het primaire doel van GenOO-HTS is om eenvoudige HTS-analyses gemakkelijke en gecompliceerde analyses mogelijk te maken. GenOO-HTS modelleert biologische entiteiten in Perl-objecten en biedt relevante attributen en methoden die de manipulatie van high-throughput sequencing-gegevens mogelijk maken. Het gebruik van GenOO-HTS als een kernontwikkelingsmodule vermindert de overhead en de complexiteit van het beheer van de gegevens en de biologische entiteiten die voorhanden zijn. GenOO-HTS is ontworpen om flexibel en gemakkelijk uitbreidbaar te zijn met een modulaire structuur en minimale vereisten voor externe tools en bibliotheken.Kenmerken
- Organiseer biologische entiteiten als perl-objecten (genomische regio's, genen, transcripten, introns/exons, enz.)
- Organiseer sequencing-entiteiten als perl-objecten/attributen (sequencing-lezingen, uitlijningen, enz.)
- Maak I/O van veelgebruikte bestandsformaten eenvoudig (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Wees consistent en gemakkelijk uitbreidbaar
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, ontwikkelaars
Programmeertaal
Perl
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/genoo/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
