Dit is de Linux-app genaamd GMATA-software voor Genomic SSR-marker waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als GMATAv2.2.jar. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam GMATA-software voor Genomic SSR-marker gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
GMATA-software voor Genomic SSR-marker
PRODUCTBESCHRIJVING
Wat is software GMATA v21
Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) is software voor Simple Sequence Repeats (SSR)-analyses en het ontwerpen en in kaart brengen van SSR-markers in alle DNA-sequenties. Het heeft de volgende functies:
1. SSR-mijnbouw;
2. Statistische analyse en plotten;
3. Grafisch bekijken van SSR-loci;
4. Markering ontwerpen;
5. Onderzoek naar elektronische mapping en overdraagbaarheid van markeringen.
GMATA is nauwkeurig, gevoelig en snel. Het is ontworpen om grote datasets van genoomsequenties te verwerken, met name grote hele genoomsequenties. In theorie kunnen genomen van elke grootte eenvoudig door GMATA worden geanalyseerd. Software GMATA werkt op servers, desktops of zelfs laptops en kan met slechts enkele muisklikken in een grafische interface worden uitgevoerd of in een opdrachtregel of in een geautomatiseerde pijplijn worden uitgevoerd. Het is ook platformonafhankelijk en ondersteunt Unix/Linux, Win en Mac. Resultaten van software GMATA kunnen direct grafisch worden weergegeven met genoom- of genkenmerken in Gbrowser en eenvoudig worden geïntegreerd met elke genomische database.
Voordelen
- Nauwkeurige en snelste SSR-mijnbouw in grote reeksen
- Volledige statistische analyse en plotten
- SSR-loci en markeringsgrafiek weergegeven in Gbrowser met genoomkenmerken
- Ontwerp van specifieke SSR-markers en gesimuleerde PCR
- Elektronische mapping en onderzoek naar de overdraagbaarheid van markeringen
- ook verkrijgbaar bij https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/gmata/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.