Dit is de Linux-app genaamd Kinannote, die online op Linux draait. De nieuwste versie kan worden gedownload als Kinannote_1.0.tar. De app kan online worden gebruikt via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik online deze app met de naam Kinannote, zodat u deze gratis online op Linux kunt gebruiken met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
Kinannote kan online op Linux worden uitgevoerd
PRODUCTBESCHRIJVING
Kinannote identificeert en classificeert eiwitkinasen in een door de gebruiker verstrekt fasta-bestand met behulp van een HMM afgeleid van serine/threonine-eiwitkinasen, een positiespecifieke scorematrix afgeleid van de HMM en vergelijking met een lokale versie van de gecureerde kinasedatabase van kinase. com. Als de gebruiker een compleet proteoom invoert, evalueren aanvullende modules de volledigheid van de kinoom en plaatsen deze in context met referentie-kinomes. Kinannote draait op een Unix-opdrachtregel en is afhankelijk van lokale hmmer 2- en Blast 2.24-installaties.Onder verwijzing naar Kinannote:
Kinannote, een computerprogramma om leden van de eukaryotische proteïnekinasesuperfamilie te identificeren en te classificeren
Jonathan M. Goldberg; Allison Griggs; Janet L. Smith; Brian Haas; Jennifer Wortmann; Qiandong Zeng
Bio-informatica 2013; doi: 10.1093/bioinformatica/btt419
http: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
pdf: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Perl
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/kinannote/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
