Dit is de Linux-app met de naam lr2rmats om online in Linux te draaien, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app met de naam lr2rmats om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
lr2rmats om online in Linux te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
lr2rmats is een op Snakemake gebaseerde lichtgewicht pijplijn die is ontworpen om zowel derde generatie langgelezen als tweede generatie kortgelezen RNA-seq-gegevens te gebruiken om een verbeterd genannotatiebestand te genereren. Het nieuw gegenereerde annotatiebestand kan aan rMATS worden verstrekt voor differentiële alternatieve splitsingsanalyse.Meer informatie is te vinden op https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Kenmerken
- lang gelezen
- RNA-seq
- Alternatieve splicing
- Pacifische biowetenschappen
- Oxford Nanopore-technologieën
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Unix-shell, Python, C
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
