Dit is de Linux-app genaamd PolyCTLDesigner om online in Linux te draaien, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam PolyCTLDesigner online uit om gratis online met OnWorks in Linux te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
PolyCTLDesigner om online onder Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Gezien de peptiden (T-celepitopen) selecteert PolyCTLDesigner flankerende sequenties om TAP-binding te optimaliseren en voegt de resulterende oligopeptiden samen tot een polyepitoop op een manier die een efficiënte bevrijding van potentiële epitopen door proteasomale en/of immunoproteasomale verwerking mogelijk maakt en het aantal junctionele epitopen minimaliseert. Voor het construeren van polyepitopen maakt PolyCTLDesigner gebruik van bekende aminozuurpatronen van proteasoomsplitsing en TAP-bindingsspecificiteit. PolyCTLDesigner kan ook antigene peptiden kiezen die het geselecteerde HLA-repertoire dekken met de gewenste redundantiegraad. Gezien de antigeensequenties is PolyCTLDesigner ook in staat om T-helper-epitopen te selecteren. Voor het voorspellen van T-celepitopen gebruikt het TEpredict.Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.