Dit is de Windows-app genaamd JSiteDescriptor die online in Windows via Linux online kan worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als binaries.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam JSiteDescriptor online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
JSiteDescriptor om in Windows online via Linux online te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Een set Java-programma's die coördinaat- en chemische informatie uit PDB-bestanden extraheren.De bindingsplaatsgebieden worden geëxtraheerd met behulp van een op rasters gebaseerd schema.
Voor de bindingsplaats wordt een spatio-chemische descriptor gegenereerd op basis van het PocketMatch-algoritme van Dr. Kalidas (ook auteur van dit project).
Kenmerken
- Genereren van op PocketMatch gebaseerde vectordescriptor voor een bindingssite
- Draaien in enkele PDB-bestandsmodus of Batch-modus
- Specificatie van site als ligandbuurt - (ligandcode, naam en keten-ID)
- Specificatie van de site als PDB-subset-buurt met behulp van REGULAR EXPRESSIONS
- Specificatie van meerdere reeksen atomen langs een bindingsplaats
- Batch-modus verwerkingsbestand legt invoerparameters vast via XML-bestand + conform XSD-specificatie
- Grotere configureerbaarheid - selectie van restgroepen, straal en categorieën voor locaties
- Java Swing-technologie voor GUI
- Eenvoudige en uitbreidbare software-architectuur voor toekomstige ontwikkeling
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Java-swing
Programmeertaal
Java
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
