Dit is de Windows-app met de naam Microarray-geassocieerde motiefanalysator die online in Windows via Linux online kan worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als MAMA_latest.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer online deze app met de naam Microarray-geassocieerde motiefanalysator uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
Microarray-geassocieerde motiefanalysator om online in Windows online via Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
We ontwikkelden een nieuwe clusteringvrije methode, microarray-associated motiefanalysator (MAMA), om nieuwe cis-werkende elementen te voorspellen op basis van gewogen sequentie-overeenkomsten en genexpressieprofielen in microarray-analyses. Simulatie van genexpressie werd uitgevoerd met behulp van een ondersteunende vectormachine en gebaseerd op de aanwezigheid van voorspelde motieven en motiefparen. De nauwkeurigheid van gesimuleerde genexpressie werd gebruikt om de kwaliteit van de voorspelling te evalueren en om de parameters die in deze methode worden gebruikt te optimaliseren. Na optimalisatie simuleerde MAMA nauwkeurig meer dan 87% van de genexpressie.Zie Kakei Y, Ogo Y, Itai RN, et al. (2013) Ontwikkeling van een nieuwe voorspellingsmethode van cis-elementen om samenwerkingsfuncties van cis-elementparen in ijzertekort te veronderstellen. Rijst 6(1): 22.
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Python, Perl, C
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/microarray-motif-analyzer/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
